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| 日本扁柏核基因组微卫星的分离与鉴定 | |
| 引用本文： | 李新国,田金菊,谷尚树,津村义彦. 日本扁柏核基因组微卫星的分离与鉴定[J]. 遗传学报, 2004, 31(4): 375-379 |
| 作者姓名： | 李新国 田金菊 谷尚树 津村义彦 |
| 作者单位： | 1. 北京林业大学生物技术系,北京,100083 2. 北京林业大学林业科技股份公司,北京,100085 3. 日本森林综合研究所基因组分析实验室,日本筑波,305-8687 |
| 基金项目： | 日本科技厅STA特别研究员项目资助 (编号 :3 0 0 0 3 7)~~ |
| 摘 要： | 以日本扁柏4个种源的DNA样品为材料，经NdeⅡ酶切并电泳后回收300～1000bp DNA片段，与含有生物素标记的(CT)15探针杂交，再用磁珠(Dynabeads M280 streptavitin beads)固定杂交产物，成功地实现了日本扁柏核基因组微卫星的高效分离。以pUC118 BamH Ⅰ／BAP为载体，E．coli如为寄主，构建了日本扁柏2个富含微卫星的基因组文库，共获得2200多个阳性克隆。从构建的基因组文库中，随机挑选480个阳性克隆进行测序，发现含有微卫星的克隆比例高达65．6％，其中215个非同源性克隆共含有380个微卫星位点，平均每个克隆含1．7个。微卫星种类以与探针(CT)15互补的(GA／CT)。为主，占86．1％，同时还存在(TG／AC)。和3～4个碱基为单元构成的微卫星，如(ATAG)n、(CAGA)n、(TGA)n、(ACG)n、(TCA)n、(TCT)n等。利用Oligo5．1软件为114个含有微卫星的克隆共128个微卫星位点设计出了PCR扩增引物。 |
| 关 键 词： | 日本扁柏 微卫星 基因组 测序 |
| 文章编号： | 0379-4172(2004)04-0375-05 |
Isolation and Characterization of Nuclear Microsatellites from Chamaecypress obtusa Endl. |
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| LI Xin-Guo. Isolation and Characterization of Nuclear Microsatellites from Chamaecypress obtusa Endl.[J]. Journal of Genetics and Genomics, 2004, 31(4): 375-379 | |
| Authors: | LI Xin-Guo |
| Affiliation: | LI Xin-Guo~ |
| Abstract: | |
| Keywords: | Chamaecypress obtuse microsatellites genomics sequencing |
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