肿瘤干细胞中受H3K9me2调控的干性基因的筛选

为了分析比较甲基转移酶G9a和组蛋白H3K9me2修饰在胶质瘤干细胞与非干细胞中存在的差异,筛选出维持胶质瘤干细胞干性的相关基因。通过G9a抑制剂促进U87细胞成球和过表达G9a促进U87细胞分化的方法,培养了成球的胶质瘤干细胞和贴壁的非干细胞,这两种细胞的CD133表达差异明显。再利用H3K9me2抗体通过Ch IP-seq技术比较H3K9me2修饰在干细胞组与非干细胞组中的差异,在存在差异的基因中,对TSS±2 000 bp范围内的基因进行了GO分析,并随机选出10个转录因子进行QPCR验证,结果与Ch IP-seq实验基本一致。