| 白桦Trihelix家族全基因组鉴定及抗病表达模式分析北大核心CSCD |
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| 引用本文： | 宁小萌,孙晶晶,冯思雨,李天骄,任占辰,李然红.白桦Trihelix家族全基因组鉴定及抗病表达模式分析北大核心CSCD[J].西北植物学报,2022,42(6):920-929. |
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| 作者姓名： | 宁小萌 孙晶晶 冯思雨 李天骄 任占辰 李然红 |
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| 作者单位： | (牡丹江师范学院 生命科学与技术学院，黑龙江牡丹江 157012) |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31800558)； |
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| 摘 要： | Trihelix家族是植物中特有的一类转录因子家族,在植物生长发育、抗逆反应中具有重要的调控作用。该研究基于白桦基因组数据库,对白桦Trihelix家族基因的表达特性以及抗病功能等进行分析,为Trihelix家族成员在白桦抗病过程中的功能研究奠定基础。结果显示:(1)共筛选到白桦8个Trihelix家族成员(BpTrihelix1~BpTrihelix8),分布在6条染色体上;氨基酸分子量在35 633.96~81 871.27 Da之间,等电点在5.32~8.67之间,均为疏水性氨基酸。(2)组织特异性表达分析表明,8个家族成员在白桦根、茎、叶中均有不同程度的表达,且BpTrihelix3在根、茎、叶中的表达量均最高。(3)病原菌侵染试验结果发现,链格孢霉菌(Alternaria alternata)感染白桦植株叶片48 h和立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)感染白桦幼苗根部24 h时,BpTrihelix3、BpTrihelix4和BpTrihelix7均显著上调,其余家族基因表达量无明显变化,说明该家族基因成员中的BpTrihelix3、BpTrihelix4和BpTrihelix7响应了病原菌的感染,推测三者在白桦抗病过程中可能发挥重要作用。
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| 关 键 词： | 白桦 Trihelix家族 生物信息学 抗病 表达分析 |
Genome Identification and Disease resistant Expression Pattern Analysis of Trihelix Family of Betula platyphylla |
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| NING Xiaomeng,SUN Jingjing,FENG Siyu,LI Tianjiao,REN Zhanchen,LI Ranhong.Genome Identification and Disease resistant Expression Pattern Analysis of Trihelix Family of Betula platyphylla[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2022,42(6):920-929. |
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| Authors: | NING Xiaomeng SUN Jingjing FENG Siyu LI Tianjiao REN Zhanchen LI Ranhong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Betula platyphylla Trihelix family bioinformatics disease resistant expression analysis |
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