| 人类基因组miRNA转录调控区保守性DNA序列生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 郑红霞,窦同海,蔡燕燕,詹晓莹,沈逢焘,吴奇涵. 人类基因组miRNA转录调控区保守性DNA序列生物信息学分析[J]. 基因组学与应用生物学, 2009, 28(6). DOI: 10.3969/gab.028.001049 |
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| 作者姓名： | 郑红霞 窦同海 蔡燕燕 詹晓莹 沈逢焘 吴奇涵 |
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| 作者单位： | 华东师范大学生命科学学院,上海,200062;复旦大学生物医学研究院,上海,200040 |
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| 摘 要： | MicroRNA(miPNA)的表达调控方式一直是一个有争议的问题,为了研究miRNA潜在的转录调控特点,本文通过Sanger网站miRNA数据库获得人类miRNA的信息,并建立miRNA相关信息数据库,用MEME和Wordspy两个软件对其上游2 000 bp序列进行保守性分析,得到保守性的DNA序YU(motif),用TESS软件分析保守性DNA序列,预测其转录因子结合情况.通过比较位于基因间、反义链和内含子中的三类不同miRNA转录调控区的保守性和自主转录能力的差异,结果发现位于基因间、反义链上的miRNA上游调控区的保守性比位于内含子的miRNA高,在miRNA的转录调控区存在RNA聚合酶Ⅱ类型的转录因子结合位点,miRNA还表现出自身独特的转录调控方式.通过分析,我们还得到了miRNA表达调控中一些重要的转录因子以及独特的调控序列.本研究结果为miRNA转录调控机制的进一步研究提供了理论依据.
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| 关 键 词： | miRNA 转录调控 保守序列 生物信息学 |
Bioinformatics Analysis of Homo Genome miRNA Conserved DNA Sequences in Transcriptional Regulation Regions |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | miRNA |
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