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水痘-带状疱疹病毒Oka株和84-7株基因特征的分析
作者单位:;1.成都生物制品研究所有限责任公司病毒性疫苗二室
摘    要:目的对水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus,VZV)Oka株和84-7株的部分基因特征进行分析,为建立Oka株和84-7株的鉴别方法提供依据。方法利用PCR技术扩增相关基因,并运用生物信息学软件对水痘-带状疱疹病毒OKa株和84-7株的Pst I酶切位点、抗原蛋白基因序列(ORF14,ORF68)、高突变区域(ORF62)及84-7株复制起点进行序列比较和分析。结果 Oka株酶切位点特征为Pst I-Sma I~+Bss HII~+Nae I~+,84-7株的酶切位点特征为Pst I~+Sma I~-Bss HII~-Nae I~-;Oka株和84-7株ORF14编码的蛋白质同源性为99.8%,3个碱基的差异导致了3个氨基酸的变化,且这两株病毒株的R2可变区的串联重复单位拷贝数均为7;Oka株和84-7株ORF68编码的蛋白质同源性为100%,且存在2个低复杂性区域(LCR);ORF62编码区蛋白质的同源性为99.2%,具有14个低复杂性区域;84-7株复制起点区域包含一个13TA+19GA结构。结论 Oka株和84-7株的同源性很高,但在酶切位点方面存在差异,可用于Oka株和84-7株的鉴别,为今后确立水痘-带状疱疹病毒毒株的鉴别方法提供依据。

关 键 词:水痘-带状疱疹病毒  Oka株  84-7株  酶切位点  基因特征  同源性

Analysis of genetic characteristics of VZV Oka and 84-7 strains
Abstract:
Keywords:
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