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一种高效筛选Mx GTPase效应区SNP方法
作者姓名:尹春光  秦宏伟  彭浩  王晓强  杜立新  赵桂苹
作者单位:济宁学院生命科学与工程系;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
基金项目:国家高技术研究发展计划项目("抗重大传染性疾病转基因家禽新品种培育";No.2007AA10Z183);山东省中青年科学家奖励基金项目("鲁西南地方家禽Mx基因抗性基因型筛选与鉴定";No.BS2011NY003);国家科技支撑计划项目("鸡种质资源培育与创新利用";No.2015BAD03B03)
摘    要:[目的]建立高效检测家禽Mx功能区SNP方法 ,改进PCR SSCP。[方法]以引进品种和地方品种为研究对象,筛选引物,优化程序,通过二次PCR改进SSCP方法对Mx基因GTPase效应区SNP进行检测。[结果]SSCP检测引物分型检测及SNP分析,检测结果与测序一致。来航鸡检测到阳性结果,且PA检测的多态位点均由编码区A/G替换引起,济宁百日鸡和来航鸡两个群体PIC为0.2515和0.2628,呈低度多态。[结论]χ~2独立性检验位点基因频率和基因型频率呈Hardy-Weinberg平衡,不同品种间位点8(S631N)基因型分布差异极显著(P<0.01)。改进后的PCR SSCP高效经济简便,为高通量后期检测、新位点筛选奠定基础。

关 键 词:Mx  二次PCR-SSCP  GED区  SNP
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