| 非编码RNA的生物信息学研究方法:RNA结构预测及其应用 |
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| 引用本文： | 张浩文,杨禹丞,鲁志.非编码RNA的生物信息学研究方法:RNA结构预测及其应用[J].生命科学,2014(3). |
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| 作者姓名： | 张浩文 杨禹丞 鲁志 |
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| 作者单位： | 清华大学生命科学学院生物信息学教育部重点实验室; |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金青年基金项目(31100601);国家自然科学基金面上项目(31271402);国家重点基础研究发展计划(“973”项目)(2012CB316503);国家高技术研究发展计划(“863”项目)(2014AA021100);IBM基金;Bayer基金;罗氏基金 |
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| 摘 要： | 近10多年来的研究逐步揭示了RNA的各种生物学功能。RNA不仅是信息从DNA传递到蛋白质的中间体,还直接参与基因沉默、表观遗传学修饰等生物学过程。单链的RNA在体内通过碱基配对折叠成一定的二级结构。介绍了现在预测RNA二级结构的主要算法及其应用,其中包括基于热力学、同源比对和统计学习的各种算法,以及如何引入实验数据辅助预测。二级结构预测算法被广泛用于寻找RNA功能单元和预测新非编码RNA等各种问题。如何利用高通量实验数据帮助结构预测,探索长非编码RNA功能,研究RNA与蛋白质相互作用,是RNA二级结构预测算法和应用的一些前沿方向。
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| 关 键 词： | RNA二级结构预测 自由能 共突变 非编码RNA |
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