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我国西部1a型丙肝病毒结构区的cDNA克隆和序列分析
引用本文:祁欣,贾文祥,杨春,杨远,曾蔚,陈恬.我国西部1a型丙肝病毒结构区的cDNA克隆和序列分析[J].生物技术通讯,2004,15(2):118-121.
作者姓名:祁欣  贾文祥  杨春  杨远  曾蔚  陈恬
作者单位:四川大学,华西医学中心基础医学与法医学院微生物学教研室,成都,610041
摘    要:克隆我国西部丙型肝炎病毒全部结构区基因,为探讨HCV的变异和致癌作用,研制丙肝疫苗作准各。从1名西安市丙肝感染血液中,用Trizol试剂裂解HCV病毒颗粒,用糖原与RNA共沉淀提取HCVRNA,用AMV逆转录酶和随机引物逆转录为eDNA,用RT-PCR方法扩增目的片段并转化到pGEM-T质粒,得到pGEM-T-HCVc、pGEM-T-HCVel和pGEM-T-HCVe2克隆。将以上3个克隆用特定的酶降解,用连结酶进行连接,构建了HCV结构区的完整克隆。将克隆好的质粒pGEM-T-HCVjg从两端双向测广手,得到完整的HCV结构基因eDNA核苷酸序列,总长度为2238bp,与已发表的HCV序列长度一致,未发现缺失或移码突变,序列中间亦未发现转录终止子。本序列与HCVla、lb序列核苷酸的同源性分别为91.8%、84.5%;氨基酸的同源性分别为94.2%、86.3%;应为HCVla亚型。以上结果说明我国西部地区存在HCVla亚型,所克隆HCV结构区eDNA克隆可以用于基因工程表达。

关 键 词:丙型肝炎病毒  cDNA克隆  序列分析  HCV  变异
文章编号:1009-0002(2004)02-0118-04
修稿时间:2003年7月20日

Cloning and sequencing of hepatitis C virus construct genomes from western China
QI Xin,JIA Wen-xiang,YANG Chun,YANG Yuan,ZENG Wei,CHEN Tian.Cloning and sequencing of hepatitis C virus construct genomes from western China[J].Letters in Biotechnology,2004,15(2):118-121.
Authors:QI Xin  JIA Wen-xiang  YANG Chun  YANG Yuan  ZENG Wei  CHEN Tian
Institution:QI Xin,JIA Wen-xiang,YANG Chun,YANG Yuan,ZENG Wei,CHEN TianDepartment of Microbiology,Basic Medical College,Huaxi Medical Center,Sichuan University,Chengdu 610045,China
Abstract:
Keywords:hepatitis C virus  cDNA cloning  homology
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