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| 贝叶斯推论及其在百合目分子系统学中的应用 | |
| 引用本文： | 陈士超,杨红,李珊,祝建,傅承新.贝叶斯推论及其在百合目分子系统学中的应用[J].云南植物研究,2007,29(2):161-166. |
| 作者姓名： | 陈士超 杨红 李珊 祝建 傅承新 |
| 作者单位： | 1. 同济大学生命科学与技术学院,上海,200092;浙江大学生命科学学院系统进化植物学与生物多样性实验室,浙江,杭州,310058 2. 同济大学生命科学与技术学院,上海,200092 3. 浙江大学生命科学学院系统进化植物学与生物多样性实验室,浙江,杭州,310058 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金;同济大学校科研和校改项目 |
| 摘 要： | 贝叶斯推论作为进化生物学的最新进展,在适用复杂模型、大型数据集、计算速度和结果容易解释等方面明显优于其它算法。本文简要介绍了贝叶斯推论原理及其在分子进化和系统发育研究中的重要性,并使用该方法对百合目主要类群的系统发育关系进行了重建。结果显示,百合目rbcL基因最适合的DNA进化模型为GTR I G,贝叶斯法与距离法和最大简约法构建的系统发育树拓扑结构相似,没有显著差异,但是分辨率和支持率明显比后者高。贝叶斯分析结果显示,百合目内划分的7个科,除Smilacaceae科外,其余各科均为高后验概率(PP=1·0)支持的单系类群;文中作者还对各科间的系统关系进行了探讨。 |
| 关 键 词： | 百合目 贝叶斯推论 系统发育 |
| 文章编号： | 0253-2700（2007）02-161-06 |
| 收稿时间： | 2006-07-10 |
| 修稿时间： | 2006-10-08 |
Bayesian Inference and Its Application in the Molecular Phylogeny of Liliales |
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| CHEN Shi-Chao,YANG Hong,LI Shan,ZHU Jian,FU Cheng-Xin.Bayesian Inference and Its Application in the Molecular Phylogeny of Liliales[J].Acta Botanica Yunnanica,2007,29(2):161-166. | |
| Authors: | CHEN Shi-Chao YANG Hong LI Shan ZHU Jian FU Cheng-Xin |
| Institution: | 1. College of Life Science and Technology, Tongji University, Shanghai 200092, China;2 College of Life Science, Zhejiang University, Hangzhou 310029, China |
| Abstract: | |
| Keywords: | rbcL |
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