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长心卡帕藻RAPD-PCR反应体系的正交优化研究
引用本文:赵素芬,张婷,应成琦,何培民.长心卡帕藻RAPD-PCR反应体系的正交优化研究[J].生物技术通报,2008(4).
作者姓名:赵素芬  张婷  应成琦  何培民
作者单位:1. 上海水产大学生命科学与技术学院,上海,200090;广东海洋大学水产学院,湛江,524025
2. 上海水产大学生命科学与技术学院,上海,200090
基金项目:上海浦江人才计划项目 , 上海市教委优势(重点)学科资助项目
摘    要:采用SDS(十二烷基硫酸钠,20%)法提取了大型海藻长心卡帕藻(Kappaphycus alvarezii)基因组DNA.通过单因子梯度试验,确定了影响随机扩增DNA多态性(RAPD)扩增结果的模板、Mg2 、dNTPs、S22引物、Taq的适宜浓度、退火温度和反应的最佳循环次数;利用正交试验优化了模板、Mg2 、dNTPs、S22引物、Taq的配比浓度.结果表明,在进行长心卡帕藻的RAPD扩增时,在总体积为25μl的反应体系中,模板、Mg2 、dNTPs、S22引物、Taq的最佳浓度分别为15ng、2.0mmol/L、0.2mmol/L、0.25μmol/L、2.5U;退火温度为37℃.反应程序为94℃预变性5min,然后经94℃变性30s、37℃退火1min.72℃延伸2min,进行30次循环,最后在72℃再延伸10min.

关 键 词:长心卡帕藻  DNA提取  随机扩增DNA多态性  反应体系

Study on Optimization of RAPD-PCR Reaction System for Kappaphycus alvarezii by Orthogonal Design
Abstract:
Keywords:
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