| 微生物酶数据库的发展与应用 |
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| 引用本文： | 孙瑨原,朱彤,李涛,崔颖璐,吴边. 微生物酶数据库的发展与应用[J]. 微生物学报, 2021, 61(12): 3783-3798 |
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| 作者姓名： | 孙瑨原 朱彤 李涛 崔颖璐 吴边 |
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| 作者单位： | 中国科学院微生物研究所, 中国科学院微生物生理与代谢工程重点实验室, 微生物资源前期开发国家重点实验室, 北京 100101;中国科学院大学生命科学学院, 北京 100049 |
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| 基金项目： | 中国科学院战略性先导科技专项(XDA24020101)；中国科学院战略生物资源计划(KFJ-BRP-009， KFJ-BRP-017-58) |
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| 摘 要： | 可数据化是现代生命科学研究,尤其是合成生物学的一项关键特性。酶作为生命体内催化生化反应的关键分子,其数据化对推动生命科学的基础研究和实际应用都有重要意义。当下商品化的酶大都来源于微生物,建立微生物酶资源数据库不仅可以为酶的分类提供标准参考,还可以指导新型催化元件的挖掘、改造与从头设计。本综述对国际上已有的酶资源数据库建设与发展作了简要介绍,并对基于数据库的微生物酶资源利用作出展望。
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| 关 键 词： | 酶数据库 大数据 微生物资源 |
| 收稿时间： | 2021-01-19 |
| 修稿时间： | 2021-03-11 |
Development and applications of enzyme databases |
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| Jinyuan Sun,Tong Zhu,Tao Li,Yinglu Cui,Bian Wu. Development and applications of enzyme databases[J]. Acta microbiologica Sinica, 2021, 61(12): 3783-3798 |
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| Authors: | Jinyuan Sun Tong Zhu Tao Li Yinglu Cui Bian Wu |
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| Affiliation: | CAS Key Laboratory of Microbial Physiological and Metabolic Engineering, State Key Laboratory of Microbial Resources, Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China;College of Life Sciences, University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China |
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| Abstract: | Enzymes catalyze most biochemical reactions in living organisms, and the high efficiency, chemo-, regio- and stereoselectivity make enzymes appealing catalysts in many fields. The digitalization of enzyme-related information is of great importance to both academic research and industrial applications. Microbial enzyme resource databases establish foundations for the mining, engineering, and utilization of new biocatalysts. This mini-review will briefly introduce the current development of enzyme databases and discuss the enzyme resources applications facilitated by databases. |
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| Keywords: | enzyme database big data microbial resources |
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