| 沙田柚RING-H2 finger基因的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李惠敏,罗琼,肖君,李少梅,刘华英,秦新民.沙田柚RING-H2 finger基因的生物信息学分析[J].生物信息学,2017,15(3):149-155. |
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| 作者姓名： | 李惠敏 罗琼 肖君 李少梅 刘华英 秦新民 |
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| 作者单位： | 广西师范大学 生命科学学院,广西 桂林 541004,广西师范大学 生命科学学院,广西 桂林 541004,广西师范大学 生命科学学院,广西 桂林 541004,广西师范大学 生命科学学院,广西 桂林 541004,广西师范大学 生命科学学院,广西 桂林 541004,广西师范大学 生命科学学院,广西 桂林 541004 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31360477)；广西高校科研项目(2013YB036). |
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| 摘 要： | 为探讨沙田柚自交不亲和性的机理,利用高通量测序技术对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序,通过差异分析得到了沙田柚RING-H2 finger基因序列。采用生物信息学方法,对其编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、高级结构以及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明:该基因全长为845 bp,开放阅读框(ORF)全长为387 bp,编码128个氨基酸,编码蛋白质的分子量为13.61 KDa,理论等电点为4.26;该蛋白质含有一个植物RING-H2 finger蛋白家族的保守结构域,为疏水性不稳定蛋白。氨基酸序列分析表明,其编码的氨基酸与甜橙(Cs4g15340.1)RING-H2 finger蛋白的相似度为98%。这些分析结果可为今后深入研究该蛋白的结构特征和功能提供参考。
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| 关 键 词： | 沙田柚 RING-H2 finger蛋白基因 生物信息学 环指结构域 |
| 收稿时间： | 2017/1/20 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2017/5/4 0:00:00 |
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