| 斑马鱼TATA结合蛋白的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 杨少斌,冯婧文,赵文铖,王兆松,许世磊.斑马鱼TATA结合蛋白的生物信息学分析[J].生命科学研究,2015(2):119-123,136. |
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| 作者姓名： | 杨少斌 冯婧文 赵文铖 王兆松 许世磊 |
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| 作者单位： | 天津医科大学肿瘤医院国家肿瘤临床医学研究中心天津市肿瘤防治重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(81301711) |
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| 摘 要： | 斑马鱼TATA结合蛋白(TBP)是转录过程中的重要起始因子。利用生物信息学方法对斑马鱼TBP的理化性质、物种间同源性、保守结构域、跨膜区、亲水性/疏水性、蛋白质二级结构、蛋白质三级结构、蛋白质相互作用进行预测分析。分析表明,斑马鱼TBP全长302个氨基酸,等电点9.8,属于TATA结合蛋白超家族,不含跨膜区,属于亲水蛋白;二级结构以无规则卷曲为主,含5个α螺旋区和8个β折叠区,三维建模空间结构可信度98.9%,进一步分析建模结果可靠;与斑马鱼TBP相互作用的蛋白质均为转录因子或TFⅡD复合物组分。分析结果对于深入研究斑马鱼TBP在基因转录中的作用具有一定的理论指导意义。
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| 关 键 词： | 斑马鱼 TATA结合蛋白 生物信息学 |
Bioinformatic Analysis of TATA-binding Protein of Zebrafish |
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| YANG Shao-bin;FENG Jing-wen;ZHAO Wen-cheng;WANG Zhao-song;XU Shi-lei.Bioinformatic Analysis of TATA-binding Protein of Zebrafish[J].Life Science Research,2015(2):119-123,136. |
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| Authors: | YANG Shao-bin;FENG Jing-wen;ZHAO Wen-cheng;WANG Zhao-song;XU Shi-lei |
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| Institution: | YANG Shao-bin;FENG Jing-wen;ZHAO Wen-cheng;WANG Zhao-song;XU Shi-lei;Tianjin Medical University Cancer Institute and Hospital, National Clinical Research Center for Cancer, Tianjin Key Laboratory of Cancer Prevention and Therapy; |
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