拟南芥和水稻CPP转录因子家族的生物信息学分析 |
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引用本文: | 王凯.拟南芥和水稻CPP转录因子家族的生物信息学分析[J].生物技术通报,2010(2). |
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作者姓名: | 王凯 |
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作者单位: | 中国水稻研究所国家水稻改良中心,水稻生物学国家重点实验室,杭州310006 |
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基金项目: | 2008年度中国水稻研究所自主研究课题 |
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摘 要: | CPP(cystein-rich polycomb-like protein or Tesmin/TOS1-like)家族是含有保守的富含Cystein的CRC结构域的蛋白质的统称,参与花器官的发育,在控制生殖组织发育和细胞分裂过程中起着极其重要的作用。本研究系统鉴定了8个拟南芥(Arabidopsis thaliana)和11个水稻(Orysa sativa japonicacv.Nipponbare)的CPP基因,并对这些基因编码的蛋白质序列进行了序列保守性和系统进化分析,最后对相关基因的表达进行了分析。结果表明,所有的CPP转录因子都具有高度保守的CRC结构域;单子叶和双子叶植物分化之前,植物CPP基因发生过大幅度的扩张;尽管C1域和C2域氨基酸序列一致性较高,但在该蛋白质的生物学功能中可能起着不同的作用;CPP基因主要在花组织中表达,在拟南芥中,AtCPP5、AtCPP6和AtCPP7极有可能存在功能互补作用。
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关 键 词: | CPP基因 CRC结构域 基因家族 系统进化树 功能互补 |
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