| miR-335在肿瘤组织中的表达及其预测靶基因的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 陈利娜,滕牧洲,卢严方,郑文岭,马文丽. miR-335在肿瘤组织中的表达及其预测靶基因的生物信息学分析[J]. 中国生物工程杂志, 2016, 36(3): 23-30. DOI: DOI:10.13523/j.cb.20160304 |
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| 作者姓名： | 陈利娜 滕牧洲 卢严方 郑文岭 马文丽 |
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| 作者单位： | 南方医科大学基因工程研究所 广州 510515 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(39880032),广东省领军人才基金(C1030925)资助项目 |
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| 摘 要： | 目的:分析miR-335在多种肿瘤组织与癌旁组织中的表达,预测其靶基因并进行相关生物信息学分析,为进一步研究miR-335在肿瘤中的调控机制提供理论基础。方法:分析miR-335的保守性及在多个肿瘤组织中的表达;预测miR-335靶基因,并使用DAIVID对miR-335靶基因进行生物信息学分析。结果:miR-335序列高度保守,在肝癌、肺癌、乳腺癌、肝内胆管癌、脂肪肉瘤中表达下调(P<0.05)。预测miR-335靶基因共34个,靶基因集合功能富集于细胞迁移、凋亡、转录调控,以及蛋白质分子连接、细胞骨架组成等生物学过程和分子功能(P<0.05);主要参与了轴突向导和黏着斑信号通路、黑素瘤疾病信号通路及TGF-β信号通路(P<0.05)。结论:miR-335在多种肿瘤中表达异常,且涉及多个生物学过程和信号转导通路,与肿瘤的发生发展密切相关。
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| 关 键 词： | 肿瘤 miR-335 靶基因 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2015-10-27 |
miR-335 Expression in Tumor Tissues and Bioinformatic Analysis of Predicted Target Genes |
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| CHEN Li-na,TENG Mu-zhou,LU Yan-fang,ZHENG Wen-ling,MA Wen-li. miR-335 Expression in Tumor Tissues and Bioinformatic Analysis of Predicted Target Genes[J]. China Biotechnology, 2016, 36(3): 23-30. DOI: DOI:10.13523/j.cb.20160304 |
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| Authors: | CHEN Li-na TENG Mu-zhou LU Yan-fang ZHENG Wen-ling MA Wen-li |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Target gene Tumor miR-335 Bioinformatics |
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