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鲈鱼ZnT基因的cDNA克隆及生物信息学分析
引用本文:舒欢欢,郑伟贤,钱云霞. 鲈鱼ZnT基因的cDNA克隆及生物信息学分析[J]. 生物学杂志, 2015, 0(1): 6-9
作者姓名:舒欢欢  郑伟贤  钱云霞
作者单位:宁波大学海洋学院应用海洋生物技术教育部重点实验室
基金项目:浙江省科技厅创新团队项目(2010R50029)
摘    要:锌转运蛋白(zinc transporters,Zn T)在细胞锌的储藏,释放和分布中起了重要的作用。运用RT-PCR和SMART RACE方法从鲈鱼肝脏克隆得到了鲈鱼Zn T基因全长c DNA序列。结果显示,鲈鱼Zn T全长为1747 bp,包括5’非翻译区84 bp,3’非翻译区490 bp,开放阅读框1173 bp,可编码390个氨基酸。生物信息学分析表明该蛋白有6次跨膜结构,N端和C端均位于细胞膜内侧,第IV和第V跨膜区之间的环富含组氨酸。鲈鱼Zn T的氨基酸序列与其他生物的Zn T7序列有高度的相似性:斑马鱼,85.6%;大西洋鲑,85.4%;红鳍东方鲀,84.3%;人,75.1%;小鼠,73.8%。聚类分析显示鲈鱼Zn T首先与其它鱼类和人Zn T7成一簇,再与鱼的其他类别Zn T聚合,说明分离到的鲈鱼Zn T为Zn T7。

关 键 词:鲈鱼  ZnT  克隆

Cloning and bioimformatics analysis of cDNA ZnT in Lateolabrax japonicus
SHU Huan-huan;ZHENG Wei-xian;QIAN Yun-xia. Cloning and bioimformatics analysis of cDNA ZnT in Lateolabrax japonicus[J]. Journal of Biology, 2015, 0(1): 6-9
Authors:SHU Huan-huan  ZHENG Wei-xian  QIAN Yun-xia
Affiliation:SHU Huan-huan;ZHENG Wei-xian;QIAN Yun-xia;Key Lab of Applied Marine Biotechnology,Minsstry of Education,School of Marine Sciences,Ningbo University;
Abstract:
Keywords:
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