埃可病毒9型荧光RT-PCR快速检测方法的建立及应用 |
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引用本文: | 邱晓枫,张国忠,黄志成,潘劲草,于新芬.埃可病毒9型荧光RT-PCR快速检测方法的建立及应用[J].病毒学报,2017,33(6):836-841. |
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作者姓名: | 邱晓枫 张国忠 黄志成 潘劲草 于新芬 |
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作者单位: | 杭州市疾病预防控制中心,杭州,310021;杭州市疾病预防控制中心,杭州,310021;杭州市疾病预防控制中心,杭州,310021;杭州市疾病预防控制中心,杭州,310021;杭州市疾病预防控制中心,杭州,310021 |
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基金项目: | 杭州市科技发展计划项目;题目;杭州市农业与社会发展科研计划项目;题目;The present work was supported by the Hangzhou Science and Technology Development Plan Project;Hangzhou Agricultural and Social Development Research Project |
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摘 要: | 为了建立特异、灵敏、快速的荧光定量RT-PCR方法用于检测埃可病毒9型病毒核酸,并初步应用于埃可病毒9型的临床标本检测。根据GenBank登录的埃可病毒9型毒株VP1基因序列,应用生物学软件进行序列比对,在保守区设计特异性引物和TaqMan探针。对反应条件进行优化,验证方法的特异性、灵敏度和重复性,同时对疑似埃可病毒9型病例标本进行检测。该方法对埃可病毒9型的检出有高度特异性,与EV71、CA16、CA24v、CA6、CA10、埃可病毒30型等均无交叉反应,检测灵敏度均达0.1TCID50/mL,可从疑似埃可病例粪便标本中直接检测病毒核酸,检测仅需3~4h。本研究建立的埃可病毒9型TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法特异、灵敏,适用于临床早期诊断。
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关 键 词: | 埃可病毒9型(ECHO-9) 荧光定量RT-PCR TaqMan探针 |
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