高致病性A(H5N6)亚型禽流感病毒全基因组序列测定方法的建立 |
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作者姓名: | 李晓丹 张烨 邹淑梅 薄洪 王大燕 舒跃龙 |
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作者单位: | 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,卫生部医学病毒和病毒病重点实验室,北京102206;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,卫生部医学病毒和病毒病重点实验室,北京102206;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,卫生部医学病毒和病毒病重点实验室,北京102206;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,卫生部医学病毒和病毒病重点实验室,北京102206;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,卫生部医学病毒和病毒病重点实验室,北京102206;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,卫生部医学病毒和病毒病重点实验室,北京102206 |
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基金项目: | 2014ZX10004002) |
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摘 要: | 建立以Sanger测序方法为基础的新型A(H5N6)亚型禽流感病毒全基因组扩增方法。从GenBank和Global Initiative on Sharing All Influenza Data(GISAID)下载近五年H5亚型流感病毒的HA基因序列,N6亚型流感病毒的NA基因序列,以及H5N1和H9N2亚型流感病毒内部6个基因序列,每个基因序列分别进行比对,在相对保守区域设计用于分段扩增的引物,共32对,选用3株病例分离病毒及6株环境分离病毒对引物进行验证。优化后的32对引物能够有效地扩增9株H5N6亚型禽流感病毒,其中3株病例分离病毒的扩增产物条带单一,无非特异扩增。6株环境标本分离病毒扩增产物中,个别反应有非特异扩增产物。建立了一种能够获得高致病性H5N6亚型禽流感病毒全基因组序列的Sanger测序方法,该方法简单、快速,为新型H5N6亚型禽流感病毒的进化分析提供了基础。
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关 键 词: | 流感病毒 A(H5N6) 全基因组 序列测定 |
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