绿豆Ty1/Copia类反转录转座子逆转录酶序列的克隆和分析 |
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引用本文: | 肖卫民,坂本亘,苏都莫日根.绿豆Ty1/Copia类反转录转座子逆转录酶序列的克隆和分析[J].Journal of Integrative Plant Biology,2004,46(5). |
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作者姓名: | 肖卫民 坂本亘 苏都莫日根 |
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作者单位: | 肖卫民 (北京大学生命科学学院,北京,100871) ; 坂本亘 (Research Institute for Bioresources,Okayama University,2-20-1 Chuo,Kurashiki,71 0-0046,Japan) ; 苏都莫日根 (Research Institute for Bioresources,Okayama University,2-20-1 Chuo,Kurashiki,71 0-0046,Japan) ; |
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基金项目: | 国家重点基础研究发展计划(973计划),国家自然科学基金 |
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摘 要: | 利用Ty1/copia类反转录转座子的保守位点设计简并引物,从绿豆(Vigna radiata(L.)Wilczek)基因组中扩增得到了反转录转座子的逆转录酶序列.对扩增得到的约270bp的片段进行分离和克隆,并随机挑选了40个克隆进行测序,结果得到了36个单独的核酸序列,其中18个含有移码突变或终止子.根据序列比对,这些克隆可分为9组以及单个的9种.这40个克隆中,核酸序列相似性从8%到100%,显示出其核酸序列的高度异质性.将这些克隆的核酸序列与来自其他种植物的相应序列进行谱系分析,发现有些克隆与来自其他种植物的相应序列的亲缘关系比这些克隆之间更为接近.斑点杂交显示Ty1/copia反转录转座子约占绿豆基因组的9.3%.
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关 键 词: | 绿豆 反转录转座子 逆转录酶 |
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