MicroRNA靶基因的寻找及鉴定方法研究进展 |
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引用本文: | 夏伟,曹国军,邵宁生.MicroRNA靶基因的寻找及鉴定方法研究进展[J].中国科学C辑,2009,39(1):121-128. |
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作者姓名: | 夏伟 曹国军 邵宁生 |
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作者单位: | 军事医学科学院基础医学研究所;生物化学与分子生物学研究室; |
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基金项目: | 国家重点基础研究发展计划(批准号:2005CB724600);;国家自然科学基金(批准号:30600110)资助项目 |
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摘 要: | microRNA(miRNA)的生物学功能是人们非常关注的问题.而miRNA靶基因的确定是研究miRNA生物学功能的关键.目前有关miRNA靶基因的确定主要靠计算机生物信息学软件预测和生物学实验方法.其中生物信息学方法主要根据已证实的miRNA及其靶基因序列之间相互作用的规律性,遵循几个常用原则设计的软件完成,如miRanda,TargetScan和TargetScanS,RNAhybrid,DIANA-microT,PicTar,RNA22及FindTar等.生物学实验方法主要是利用免疫共沉淀寻找与AGO蛋白相互作用的mRNA,或研究受miRNA调控的mRNA水平和蛋白质水平变化来寻找miRNA靶基因.计算机预测方法和生物学实验方法相互补充和完善,使人们能够更加方便地确定miRNA的靶基因,从而进一步研究其生物学功能.本文主要介绍了miRNA靶基因的寻找及鉴定方法的研究进展.
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关 键 词: | miRNA 靶基因 预测 鉴定 |
收稿时间: | 2008-09-17 |
修稿时间: | 2008-11-28 |
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