基于高通量RNA测序数据分析的弹性云平台 |
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作者姓名: | 吴一雷 闫鹏程 刘充 陈禹保 赵文明 |
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作者单位: | 1.北京市科学技术研究院, 北京市计算中心, 北京 100012;
2.中国科学院, 北京基因组研究所, 北京 100029 |
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摘 要: | 高通量RNA测序(RNA-seq)技术为研究人员提供了海量数据,如何对这些数据进行快速有效的分析,并为后续转录组、基因表达等研究提供支持,是生物信息学领域的热点方向。本文讨论了当前RNA-seq数据分析的发展水平和常用软件、算法,并设计了一系列数据处理模块和分析流程。同时,为了给用户提供更好的使用环境,我们设计了基于弹性资源管理系统的生物云平台BioCloud。该平台集成了丰富的软件,采用高灵活度、高扩展性的体系架构,在给用户提供低成本、高性能计算服务的同时,还提供个性化的流程定制服务。
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关 键 词: | 高通量测序 转录组分析 弹性云平台 基因组数据库 分布式系统 |
收稿时间: | 2011-12-19 |
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