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基于高通量RNA测序数据分析的弹性云平台
作者姓名:吴一雷  闫鹏程  刘充  陈禹保  赵文明
作者单位:1.北京市科学技术研究院, 北京市计算中心, 北京 100012; 2.中国科学院, 北京基因组研究所, 北京 100029
摘    要:高通量RNA测序(RNA-seq)技术为研究人员提供了海量数据,如何对这些数据进行快速有效的分析,并为后续转录组、基因表达等研究提供支持,是生物信息学领域的热点方向。本文讨论了当前RNA-seq数据分析的发展水平和常用软件、算法,并设计了一系列数据处理模块和分析流程。同时,为了给用户提供更好的使用环境,我们设计了基于弹性资源管理系统的生物云平台BioCloud。该平台集成了丰富的软件,采用高灵活度、高扩展性的体系架构,在给用户提供低成本、高性能计算服务的同时,还提供个性化的流程定制服务。

关 键 词:高通量测序  转录组分析  弹性云平台  基因组数据库  分布式系统  
收稿时间:2011-12-19
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