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紫色红曲霉Mp-21 MpMcrA基因的克隆与生物信息学分析
引用本文:潘妍妍,王嘉琦,杨孙玉悦,蒋冬花. 紫色红曲霉Mp-21 MpMcrA基因的克隆与生物信息学分析[J]. 微生物学杂志, 2023, 0(3): 11-18
作者姓名:潘妍妍  王嘉琦  杨孙玉悦  蒋冬花
作者单位:浙江师范大学 化学与生命科学学院,浙江 金华 321004
基金项目:国家自然科学基金项目(31570013)
摘    要:McrA为最近在构巢曲霉(Aspergillus nidulans)中发现的全局调控因子,具有调控丝状真菌生长发育和次级代谢的作用,利用生物信息学分析方法找到并克隆紫色红曲霉(Monascus purpureus)中mcrA基因,将其命名为MpMcrA。分析MpMcrA蛋白质理化性质、亲疏水性、亚细胞定位、信号肽、跨膜区域及磷酸化位点、转录因子结合位点以及蛋白质二级结构。利用ProtParam、ProtScale、PSORTII、SignalP4.1等生物信息学软件对MpMcrA进行系统分析。 结果表明,MpMcrA基因长1 356 bp,其中含有3个外显子,2个内含子,编码410个氨基酸,与构巢曲霉序列比对蛋白相似性高达64%。预测结果显示,MpMcrA属于亲水蛋白,位于细胞核可能性大,不存在跨膜区域,不属于膜蛋白;不存在剪切位点,不属于分泌蛋白;基因含有54个潜在的磷酸化位点;可能存在5个转录因子结合位点;蛋白结构大部分为无规则卷曲,整体结构较松散。对MpMcrA基因进行了生物信息学分析,得到了基因特征和分析结果。初步确定MpMcrA基因为构巢曲霉同源mcrA基因,在红曲霉中未见有报道。

关 键 词:紫色红曲霉;全局调控因子;生长发育;次级代谢;生物信息学;MpMcrA基因

Cloning and Bioinformatics Analysis of Mp-21 MpMcrA Gene from Monascus purpureus
PAN Yan-yan,WANG Jia-qi,YANG Sun-yu-yue,JIANG Dong-hua. Cloning and Bioinformatics Analysis of Mp-21 MpMcrA Gene from Monascus purpureus[J]. Journal of Microbiology, 2023, 0(3): 11-18
Authors:PAN Yan-yan  WANG Jia-qi  YANG Sun-yu-yue  JIANG Dong-hua
Affiliation:Coll. of Chem. & Life Sci., Zhejiang Normal Uni., Jinhua 321004
Abstract:
Keywords:Monascus purpureus   general regulatory factor   growth and development   secondary metabolism   function prediction   MpMcrA gene
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