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| 生物胺受体配基结合区域及其位点的预测 | |
| 引用本文： | 郭志云,张怀渝,王月兰,岳俊杰,梁龙,黄培堂.生物胺受体配基结合区域及其位点的预测[J].生物物理学报,2005,21(2):95-102. |
| 作者姓名： | 郭志云 张怀渝 王月兰 岳俊杰 梁龙 黄培堂 |
| 作者单位： | 1. 军事医学科学院生物工程研究所,北京,100071;四川农业大学生命科学院原子能应用研究室,雅安,625014;病原微生物生物安全国家重点实验室,北京,100071 2. 四川农业大学生命科学院原子能应用研究室,雅安,625014 3. 军事医学科学院生物工程研究所,北京,100071;病原微生物生物安全国家重点实验室,北京,100071 |
| 摘 要： | 生物胺受体被认为是一类重要的药物靶标，用生物信息学手段寻找它的配基结合位点并分析其功能，对于药物设计具有重要的指导意义。从整体上结合可变性、疏水性和保守性构建了受体的2D螺旋横切面模型，预测出其可能的配基结合区Ⅰ、Ⅱ，其中TM3、TM4以及TM7在配基结合中起关键作用，E-Ⅱ环也参与了配基结合这一过程，这是对以往普遍认为只有TM参与配基结合的延伸。从局部上寻找了生物胺受体及其子受体的motif，提出了父家族可变子家族保守motif概念，即父家族可变区中出现的子家族保守的motif最后结合整体与局部分析结果分析了各motif的功能，预测了行使配基结合功能的motif及其相应位点，结果证明与突变实验结果有很好的吻合度。 |
| 关 键 词： | 生物胺受体 配基 motie生物信息学 功能 |
| 收稿时间： | 2005-09-20 |
The prediction of amine receptors ligand-binding region and sites |
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| GUO Zhi-yun,ZHANG Huai-yu,WANG Yue-lan,YUE Jun-jie,LIANG Long,HUANG Pei-tang.The prediction of amine receptors ligand-binding region and sites[J].Acta Biophysica Sinica,2005,21(2):95-102. | |
| Authors: | GUO Zhi-yun ZHANG Huai-yu WANG Yue-lan YUE Jun-jie LIANG Long HUANG Pei-tang |
| Institution: | 1. Institute of Biotechnology, Academy of Military Medical Science, Beijing 100071, China| 2. Sichuan Agricultural University, Yaan 625014, China| 3. State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Beijing 100071, China |
| Abstract: | |
| Keywords: | Amine receptor Ligand Motif Function Bioinformatics |
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