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| 一种中间代谢途径代谢通量的定量分析方法 | |
| 引用本文： | 张慧敏,朱江峰,清水和幸,姚善泾. 一种中间代谢途径代谢通量的定量分析方法[J]. 生物化学与生物物理进展, 2003, 30(2): 301-307 |
| 作者姓名： | 张慧敏 朱江峰 清水和幸 姚善泾 |
| 作者单位： | 1. 浙江大学化学工程与生物工程学系,杭州,310027;九州工业大学生物系统工学系,福冈,820-8520,日本 2. 九州工业大学生物系统工学系,福冈,820-8520,日本 3. 浙江大学化学工程与生物工程学系,杭州,310027 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（20276065）. |
| 摘 要： | 以13C标记的碳源，用二维核磁共振技术(1H-13C，HMQC)测定代谢中产生的氨基酸标记模式，研究对中间代谢途径胞内代谢通量进行定量分析的方法.通过开发软件包，改进同位素分布的数学模型，提出了反应映射矩阵(RMM)等概念.由简化算法，提高程序的执行效率，建立了定量分析胞内代谢通量的平台.代谢模型涉及了糖酵解途径、磷酸戊糖途径、三羧酸循环、几种回补反应、发酵途径和氨基酸合成途径. |
| 关 键 词： | 代谢通量 二维核磁共振技术 中间代谢途径 同位素分布模型 |
| 收稿时间： | 2002-10-21 |
| 修稿时间： | 2002-10-21 |
A Quantitative Analysis of Intracellular Metabolic Fluxes for Central Metabolism |
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| ZHANG Hui-Min,ZHU Jiang-Feng,KAZUYUKI SHIMIZU and YAO Shan-Jing. A Quantitative Analysis of Intracellular Metabolic Fluxes for Central Metabolism[J]. Progress In Biochemistry and Biophysics, 2003, 30(2): 301-307 | |
| Authors: | ZHANG Hui-Min ZHU Jiang-Feng KAZUYUKI SHIMIZU YAO Shan-Jing |
| Abstract: | A scheme of investigating the intracellular metabolic fluxes by isotope 13 C labeling experiments and analyzing the labeling patterns of cellular amino acids by two dimensional [ 1H 13 C] nuclear magnetic resonance spectroscopy was developed. The software package was constructed with a comprehensive and improved isotopomer model, which introduce the concept of Reaction Mapping Matrices(RMM). Thus with a simplified algorithm, the platform is established for quantitating the intracellular flux distribution and investigating the cellular metabolism more efficiently. The metabolic model includes the Embden Meyerhof Parnas, the pentose phosphate pathway, the tricarboxylic acid cycle, anaplerotic reaction sequences, some fermentative pathway and pathways involved in amino acid synthesis. |
| Keywords: | metablism flux two-dimensional nuclear magnetic resonance spectroscopy central metabolism route isomer distribution model |
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