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百合bHLH家族系统进化和花香相关基因克隆及表达分析
引用本文:武琼,刘佳鑫,赵瑛杰,梁蕤,韩美玲,李超,杜方.百合bHLH家族系统进化和花香相关基因克隆及表达分析[J].植物遗传资源学报,2024(5):813-823.
作者姓名:武琼  刘佳鑫  赵瑛杰  梁蕤  韩美玲  李超  杜方
作者单位:1. 山西农业大学园艺学院;2. 山西农业大学城乡建设学院;3. 南京农业大学园艺学院
基金项目:山西省基础研究计划自然科学研究面上项目(20210302123416);
摘    要:bHLH转录因子家族是植物中最大的转录因子家族之一。当前越来越多的植物bHLH转录因子家族被鉴定,然而百合bHLH转录因子家族的系统分析尚未见报道。本研究基于百合转录组数据,共鉴定出74个bHLH家族蛋白,均为亲水性蛋白,93%为不稳定蛋白,61%为酸性蛋白。结构域分析发现有25个保守残基的一致性≥50%,其中R16、R17、L27、L49和L59位点高度保守。此外,64个b HLH蛋白能与DNA结合,包含58个E-box结合物和46个G-box结合物。系统进化分析将百合bHLHs分为21个亚家族,基于进化树发现百合bHLHs可能执行信号转导、非生物胁迫、植物生长发育和物质合成等功能。对3个可能与罗勒烯和芳樟醇相关的基因Unigene23213_All、CL1682.Contig2_All和CL8286.Contig2_All进行了克隆,发现它们在品种间存在97.30%~99.89%的同源性。表达模式分析结果显示,三者在花、叶和鳞中均有表达。该研究为开展百合bHLH转录因子的功能研究提供了重要的序列信息。

关 键 词:百合  bHLH家族  鉴定  基因克隆  半定量RT-PCR
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