| 东北林蛙皮肤中一类新抗菌肽cDNA的克隆及成熟肽的预测 |
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| 引用本文： | 朱倩,徐艳春,肖向红.东北林蛙皮肤中一类新抗菌肽cDNA的克隆及成熟肽的预测[J].现代生物医学进展,2007,7(7):1016-1019. |
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| 作者姓名： | 朱倩 徐艳春 肖向红 |
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| 作者单位： | 1. 东北林业大学野生动物资源学院,黑龙江,哈尔滨,150040;国家林业局野生动植物检测中心,黑龙江,哈尔滨,150040
2. 东北林业大学野生动物资源学院,黑龙江,哈尔滨,150040 |
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| 摘 要： | 为进一步研究和开发高效广谱天然抗生素的抗菌肽,本文克隆东北林蛙(Rana dybowskii)的抗菌肽基因,并预测其成熟肽的有关性质。根据蛙属抗菌肽信号肽末端序列设计简并引物,以RT-PCR技术扩增皮肤中抗菌肽的cDNA,并进行克隆测序。用生物信息学软件分析cDNA序列特点,预测成熟肽的理化性质。研究发现一种长度为28个氨基酸残基的新抗菌肽dybowsin-1,该肽具有Rana box结构;与已发现的抗菌肽仅有35%的同源性;理论等电点在9.70-10.01之间;均呈阳离子性;从第3或4个氨基酸开始到第16个氨基酸形成α-螺旋结构,极性氨基酸位于螺旋轮的一侧,非极性氨基酸位于螺旋轮的另一侧;具有N-端疏水、C-端亲水的两亲性。一个个体表达5条cDNA序列编码3种不同的dybowsin-1分子,显示出该抗菌肽表达的多样性。序列分析显示,该抗菌肽可能由多基因座位编码。
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| 关 键 词： | 东北林蛙 抗茵肽 预测 |
| 文章编号： | 1673-6273（2007）07-1016-04 |
| 修稿时间： | 2007-02-262007-04-30 |
Cloning of a Novel Antibacterial Peptide Gene from Rana Dybowskii and Prediction of Matured Peptide Properties |
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| ZHU Qian,XU Yan-chun,XIAO Xiang-hong.Cloning of a Novel Antibacterial Peptide Gene from Rana Dybowskii and Prediction of Matured Peptide Properties[J].Progress in Modern Biomedicine,2007,7(7):1016-1019. |
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| Authors: | ZHU Qian XU Yan-chun XIAO Xiang-hong |
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| Institution: | 1 College of Wildlife Resources, Northeast Forestry University, Harbin 150040, China; 2 State Forestry Administration Detecting Center of Wildlife, Harbin 150040, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Rana dybowskii cDNA |
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