| 决明查尔酮合成酶的同源模建和分子模拟对接 |
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| 引用本文： | 李云双,周虹,钟德馨,方袁梦梦,王万军,廖海,周嘉裕. 决明查尔酮合成酶的同源模建和分子模拟对接[J]. 天然产物研究与开发, 2013, 25(9) |
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| 作者姓名： | 李云双 周虹 钟德馨 方袁梦梦 王万军 廖海 周嘉裕 |
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| 作者单位： | 西南交通大学生命科学与工程学院,成都,610031 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目，教育部中央高校基本科研业务费专项资金项目，国家级大学生创新创业训练计划项目 |
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| 摘 要： | 查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)是植物中类黄酮生物合成途径的关键酶,其催化对-香豆酰辅酶A和丙二酸单酰辅酶A发生缩合反应.本研究以苜蓿CHS的晶体为模板,利用同源建模构建决明CHS的三维模型.经过动力学优化后,决明CHS的三维模型与苜蓿CHS的结构极为相似,主要由α-螺旋和β-折叠构成,其中有13个α螺旋,占32.82％,15个β折叠,占19.23％,无规则卷曲占47.95％.模型验证结果表明决明CHS的三维模型具有合理的立体化学性质与氨基酸相容性.决明CHS含有两个重要的结构域:对-香豆酰辅酶A结合域与丙二酸单酰辅酶A结合域.决明CHS与对-香豆酰辅酶A、丙二酸单酰辅酶A的结合主要通过氢键与范德华力.决明CHS中Cys164、His303与活性中心的H2O能够形成电子传递体系,参与对-香豆酰辅酶A形成CHS-对-香豆酰基中间产物.本研究结果为利用此类CHS三维模型研究其催化机理和分子工程改造奠定基础.
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| 关 键 词： | 查尔酮合成酶 同源模建 分子对接 决明 类黄酮 |
Homology Modeling and Molecular Simulation Docking on Chalcone Synthase from Senna tora |
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| LI Yun-shuang , ZHOU Hong , ZHONG De-xin , FANGYUAN Meng-meng , WANG Wan-jun , LIAO Hai , ZHOU Jia-yu. Homology Modeling and Molecular Simulation Docking on Chalcone Synthase from Senna tora[J]. Natural Product Research and Development, 2013, 25(9) |
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| Authors: | LI Yun-shuang ZHOU Hong ZHONG De-xin FANGYUAN Meng-meng WANG Wan-jun LIAO Hai ZHOU Jia-yu |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Chalcone synthase homology modeling molecular docking Senna tora flavonoid |
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