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| 云南甘薯病毒的检测及主要病毒的多样性分析 | |
| 引用本文： | 包改丽,左瑞娟,饶维力,LI Ru-Hui,李凡.云南甘薯病毒的检测及主要病毒的多样性分析[J].微生物学通报,2013,40(2):236-248. |
| 作者姓名： | 包改丽 左瑞娟 饶维力 LI Ru-Hui 李凡 |
| 作者单位： | 1. 云南农业大学 农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室 云南 昆明 650201 2. 云南省农业广播电视学校 云南 昆明 650032 3. USDA-ARS National Germplasm Resources Laboratory MD Beltsville 20705 USA 4. 云南农业大学 农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室 云南 昆明 650201;USDA-ARS National Germplasm Resources Laboratory MD Beltsville 20705 USA |
| 基金项目： | 云南省科技创新团队高层次科技人才培引工程项目(No. 2011HC005); 云南省中青年科技人才培养专项资金(No. 2006PY01-37) |
| 摘 要： | 目的]明确云南甘薯病毒的种类,并对主要病毒进行遗传多样性分析.方法]利用PCR/RT-PCR技术,对采自云南16个县、市的279个甘薯样品进行扩增、测序,对所得序列应用分子生物学软件MEGA 5进行系统发育分析.结果]除普洱和祥云的样品中未检测到任何病毒外,其余14个县、市的123个甘薯样品中共检测到甘薯褪绿斑病毒(SPCFV)、甘薯羽状斑驳病毒(SPFMV)、甘薯卷叶病毒(SPLCV)、甘薯C病毒(SPVC)、甘薯G病毒(SPVG)和甘薯病毒2号(SPV2)等6种病毒.其中SPVG的检出率最高,达39.1％,为云南甘薯病毒的优势种,SPFMV和SPVC的检出率分别为26.9％和24.7％,而SPLCV检出率最低,仅为0.4％.在所检测的样品中未发现甘薯褪绿矮化病毒(SPCSV)和甘薯轻斑驳病毒(SPMMV).云南甘薯病毒多数为2-5种病毒复合侵染,占总样品数的31.9％,其中2-3种病毒复合侵染现象最为常见,单一病毒侵染占总样品数的12.2％.检出率比较低的SPCFV、SPLCV和SPV2未发现单独侵染现象.结论]云南甘薯上发生的SPFMV分离物存在EA株系和O株系,未发现RC株系,另有两个分离物同EA、O、RC之间的亲缘关系均较远,有可能是一个新的株系；SPVC和SPVG分离物均可分为3个不同的组,大部分SPVG云南分离物属于Ⅰ组. |
| 关 键 词： | 甘薯病毒病 病原检测 复合侵染 多样性分析 |
Detection of sweet potato viruses in Yunnan and genetic diversity analysis of the common viruses |
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| BAO Gai-Li,ZUO Rui-Juan,RAO Wei-Li,LI Ru-Hui and LI Fan.Detection of sweet potato viruses in Yunnan and genetic diversity analysis of the common viruses[J].Microbiology,2013,40(2):236-248. | |
| Authors: | BAO Gai-Li ZUO Rui-Juan RAO Wei-Li LI Ru-Hui and LI Fan |
| Institution: | 1,3(1.Key Laboratory of Agricultural Biodiversity for Pest Management of China’s Education Ministry, Yunnan Agricultural University,Kunming,Yunnan 650201,China)(2.Kunming B&T Agricultural School,Kunming,Yunnan 650032,China)(3.USDA-ARS,National Germplasm Resources Laboratory,Beltsville,MD 20705,USA) |
| Abstract: | |
| Keywords: | Sweet potato viral disease Causal agent detection Mixed infection Genetic diversity analysis |
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