| 基于相互作用的蛋白质功能预测 |
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| 引用本文： | 王正华,王秀鹤,王勇献,张振慧.基于相互作用的蛋白质功能预测[J].激光生物学报,2007,16(4):390-393. |
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| 作者姓名： | 王正华 王秀鹤 王勇献 张振慧 |
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| 作者单位： | 国防科技大学并行与分布处理国家重点实验室,湖南,长沙,410073 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(60603054) |
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| 摘 要： | 蛋白质功能预测是后基因时代研究的热点问题。基于相互作用的蛋白质功能预测方法目前应用比较广泛,但是当"伙伴蛋白质"(interacting partners)数目k较小时,其预测准确率不高。从蛋白质相互作用网络入手,结合"小世界网络"特性,有效解决了k较小时预测准确率不高的问题。对酵母(Saccharomyces cerevisiae)蛋白质的相互作用网络进行预测,当k≤4时其预测准确率比相同条件下的GO(global optimization)方法有一定提高。实验结果表明:该方法能够有效的应用于伙伴蛋白质数目较小时的蛋白质功能预测。
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| 关 键 词： | 蛋白质功能预测 蛋白质相互作用 小世界网络 |
| 文章编号： | 1007-7146（2007）04-0390-04 |
| 收稿时间： | 2006-11-13 |
| 修稿时间： | 2007-04-12 |
Inferring Protein Function from Protein-protein Interaction Networks |
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| WANG Zheng-hua,WANG Xiu-he,WANG Yong-xian,ZHANG Zhen-hui.Inferring Protein Function from Protein-protein Interaction Networks[J].ACTA Laser Biology Sinica,2007,16(4):390-393. |
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| Authors: | WANG Zheng-hua WANG Xiu-he WANG Yong-xian ZHANG Zhen-hui |
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| Institution: | National Laboratory for Parallel and Distributed Processing, National University of Defense and Technology, Changsha 410073, Hunan, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | protein function prediction protein-protein interaction small-world networks |
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