不携带霍乱毒素基因的CTXΦ类前噬菌体基因组克隆与分析

霍乱弧菌的霍乱毒素基因ctxAB由其溶原性噬菌体CTXΦ编码，由此携带毒素基因在产毒株与非产毒株间水平转移。从无ctxAB的El Tor型菌株中，发现不同时间、地点来源的部分菌株仍带有CTXΦ基因组的其它基因，在研究菌株染色体上呈双拷贝串联排列。克隆后测序发现基因组全长5708bp，其抑制基因rstR却与古典型菌株来源CTXΦ的相同，因此从E1 Tor菌株中发现整合有古典型来源的这类噬菌体。其它各基因与CTXΦ序列基本一致，但nctCTXΦ的zot基因末端及下游间隔区与CTXΦ的相差很大，进一步的序列测定与比较表明nctCTXΦ中无ctxAB应是其固有结构，而不是ctxAB丢失所形成的。将这种独特的前噬菌体命名为nctCTXclassΦ。研究菌株染色体上nctCTXΦ基因组上下游也各存在TLC因子和RTX毒力基因簇的同源序列，揭示它们与nctCTXΦ基因组有与CTXΦ相同的联系。从序列分析上认为nctCTXΦ与CTXΦ在遗传分化上有不同，可能是CTXΦ的前体形式，这对CTXΦ的来源、分化以及新病原产生的研究具有重要意义。