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应用RNAi技术沉默大转录本基因LRP1B
引用本文:李若,田艳艳,高勇,王山,聂桓,李钰. 应用RNAi技术沉默大转录本基因LRP1B[J]. 遗传, 2009, 31(1): 36-42. DOI: 10.3724/SP.J.1005.2008.00036
作者姓名:李若  田艳艳  高勇  王山  聂桓  李钰
作者单位:哈尔滨工业大学生命科学与工程系, 哈尔滨 150001
基金项目:国家自然科学基金,教育部归国留学人员科研基金,黑龙江省科技攻关计划 
摘    要:低密度脂蛋白受体相关蛋白1B(Lipoprotein receptor-related protein 1 B, LRP1B)是脂蛋白受体家族庞大受体亚群的成员之一, LRP1B基因编码一个长达16.5 kb的大转录本。由于LRP1B的转录产物过大限制了其功能研究。为研究LRP1B基因与肿瘤转移的相关性, 文章应用RNAi技术特异地封闭了LRP1B基因的表达。在设计siRNA过程中, 根据高效siRNA序列特征和靶序列处的mRNA二级结构特点, 对LRP1B基因多达1 100个的siRNA候选靶序列进行双重评价, 最终在基因转录本的不同位置选取了6个siRNA靶位点。针对这些靶位点, 文章构建了6个表达shRNA的pSilencer4.1重组体, 稳定转染HEK 293细胞并采用半定量RT-PCR检测各表达载体的沉默效果。结果表明, 所构建的6个shRNA-pSilencer4.1重组体中有5个对LRP1B基因形成了有效沉默(>50%), 并得到了多个完全封闭LRP1B基因表达的HEK 293细胞单克隆。

关 键 词:RNAi  大转录本基因  HEK 293  LRP1B  
收稿时间:2008-05-26
修稿时间:2008-06-26

Silencing LRP1B with huge transcript by RNAi method
LI Ruo,TIAN Yan-Yan,GAO Yong,WANG Shan,NIE Huan,LI Yu. Silencing LRP1B with huge transcript by RNAi method[J]. Hereditas, 2009, 31(1): 36-42. DOI: 10.3724/SP.J.1005.2008.00036
Authors:LI Ruo  TIAN Yan-Yan  GAO Yong  WANG Shan  NIE Huan  LI Yu
Affiliation:Department of Life Science and Bioengineering, Harbin Institute of Technology, Harbin 150001, China
Abstract:
Keywords:RNAi  LRP1B  HEK 293
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