| 核糖体小亚基V4和V9区引物扩增大亚湾真核浮游生物的比较研究 |
| |
| 引用本文： | 郭雨沛,黄良民,钟瑜,陈靖夫,谭烨辉,陈绵润,邱大俊.核糖体小亚基V4和V9区引物扩增大亚湾真核浮游生物的比较研究[J].生态科学,2023,42(1):242-251. |
| |
| 作者姓名： | 郭雨沛 黄良民 钟瑜 陈靖夫 谭烨辉 陈绵润 邱大俊 |
| |
| 作者单位： | 1. 中国科学院南海海洋研究所, 中科院热带生物资源与生态重点实验室, 广州 5103012. 中国科学院大学, 北京 101408 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金(42276165,41776154)； |
| |
| 摘 要： | 对大亚湾水体的环境DNA分别进行18S rDNA的V4和V9区的引物扩增,通过高通量测序技术进行测序,并比较分析二者浮游真核生物基因多样性和相对丰度。18S rDNA V4区引物扩增共检测出浮游动物56纲, 101目,浮游植物52纲, 69目; 18S rDNA V9区引物扩增共检测出浮游动物47纲, 81目,浮游植物56纲, 101目。两对引物对浮游真核生物扩增都具有较高覆盖度,在纲级别上二者的结果相近:颚足纲(Maxillopoda)是浮游动物优势类群;甲藻纲(Dinophyceae)、圆筛藻纲(Coscinodiscophyceae)、小豆藻纲(Mamiellophyceae)是浮游植物优势类群,其中甲藻纲多样性与丰度的结果相近,而18S rDNA V9区引物扩增得到的圆筛藻纲丰度高于18S rDNA V4区引物。分析结果表明, 18S rDNAV4区引物扩增的浮游动物多样性比18SrDNAV9区引物高,而18SrDNAV9区引物扩增的浮游植物多样性比18S rDNA V4区引物高。同时,通过高通量测序技术首次确定大亚湾海区大量存在着寄生型甲藻(Syndiniales),小豆藻目...
|
| 关 键 词： | 高通量测序 真核浮游生物 基因多样性 浮游植物 浮游动物 大亚湾 |
|
| 点击此处可从《生态科学》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《生态科学》下载免费的PDF全文 |
|
