| 恶臭假单胞菌丙氨酸消旋酶基因的克隆、序列分析及表达 |
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| 引用本文： | 曹芹,赵智,张英姿,王宇,丁久元.恶臭假单胞菌丙氨酸消旋酶基因的克隆、序列分析及表达[J].微生物学报,2006,46(1):80-84. |
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| 作者姓名： | 曹芹 赵智 张英姿 王宇 丁久元 |
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| 作者单位： | 1. 中国科学院微生物研究所,北京,100080;中国科学院研究生院,北京,100049
2. 中国科学院微生物研究所,北京,100080 |
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| 摘 要： | 从恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)200的基因组出发,用PCR方法克隆到两个独立作用的丙氨酸消旋酶基因,称之为dadX和alr。DadX编码357个氨基酸长的多肽,计算分子量为38.82kDa,alr编码409个氨基酸长的多肽,计算分子量为44.182kDa。序列分析显示,DadX的氨基酸序列与Pseudomonas putidaKT2440,铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa),鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium)和大肠杆菌(Escherichia coli)的DadX比较,相似性分别为96.64%、71.99%、44.88%和47.37%。Alr的氨基酸序列与Pseudomonas putidaKT2440比较,同源性为94.38%,而与铜绿假单胞菌(P.aeruginosa)、鼠伤寒沙门氏菌(S.typhimurium)和大肠杆菌(E.coli)的Alr比较,同源性均较低,分别为22.89%、25.72%和26.44%。在P.putida200的DadX和Alr氨基酸序列中部发现有对于酶活性至关重要的保守区域,如磷酸吡哆醛(PLP)结合位点。DadX和alr在大肠杆菌中得到表达,DadX丙氨酸消旋酶只对丙氨酸有消旋作用,而Alr丙氨酸消旋酶可以作用于丙氨酸和丝氨酸两种底物,且对丝氨酸特异性更高。Alr的表达不依赖于外源启动子,说明在其结构基因上游存在启动子结构。
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| 关 键 词： | 恶臭假单胞菌 丙氨酸消旋酶 基因克隆 表达 |
| 文章编号： | 0001-6209（2006）01-0080-05 |
| 收稿时间： | 2005-05-23 |
| 修稿时间： | 2005-07-13 |
Cloning, sequence analysis and expression of alanine racemase gene in Pseudomonas putida |
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| CAO Qin,ZHAO Zhi,ZHANG Ying-zi,WANG Yu,DING Jiu-yuan.Cloning, sequence analysis and expression of alanine racemase gene in Pseudomonas putida[J].Acta Microbiologica Sinica,2006,46(1):80-84. |
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| Authors: | CAO Qin ZHAO Zhi ZHANG Ying-zi WANG Yu DING Jiu-yuan |
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| Institution: | 1. Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100080, China ;2. Graduate School of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Pseudomonas putida Alanine racemase Serine racemase |
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