| 低密度cDNA芯片技术的优化 |
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| 引用本文： | 赵雨杰,黄宝俊,徐惠绵,何群.低密度cDNA芯片技术的优化[J].生命科学研究,2004,8(4):322-328. |
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| 作者姓名： | 赵雨杰 黄宝俊 徐惠绵 何群 |
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| 作者单位： | 1. 中国医科大学生物芯片中心,中国辽宁,沈阳,110001
2. 中国医科大学,附属第一医院,肿瘤外科,中国辽宁,沈阳,110001 |
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| 基金项目： | 辽宁省自然科学基金“基因工程关键技术研究”资助项目(2001101001) |
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| 摘 要： | 为了建立稳定的低密度cDNA芯片技术平台,研究靶基因的最适长度、浓度、点样溶液种类及杂交反应动力学,并了解该芯片的重复性与可靠性.结果表明,杂交具有较好的特异性,不同长度(189～1078bp)、浓度(0.5g/L、1.0g/L、1.5g/L)的同一靶基因杂交信号强度无明显差别;以50%DMSO为点样溶液者杂交信号最好(P=0.0001).60℃杂交18h信号最佳(P<0.001).重复2次检测结果差异无显著性(P=0.348),重复性较好,其相关系数为0.588.与RT-PCR结果相比,相关系数为-0.778(P<0.0001),特异性为100%,灵敏度为80%(16/20),可靠性较好.
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| 关 键 词： | cDNA芯片 靶基因长度和浓度 点样溶液 杂交动力学 可靠性 |
| 文章编号： | 1007-7847(2004)04-0322-07 |
| 修稿时间： | 2004年7月12日 |
Optimization of Low-density cDNA Microarray |
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| ZHAO Yu jie,HUANG Bao jun,XU Hui mian,HE Qun.Optimization of Low-density cDNA Microarray[J].Life Science Research,2004,8(4):322-328. |
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| Authors: | ZHAO Yu jie HUANG Bao jun XU Hui mian HE Qun |
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| Institution: | ZHAO Yu jie1,HUANG Bao jun2,XU Hui mian2,HE Qun1 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | cDNA microarray target gene length and concentration spotting solution hybridizing dynamics reliability |
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