应用宏基因组纳米孔测序技术分析流行性腮腺炎样病例病原体 |
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引用本文: | 韩桃利,焦洋,赵剑虹,张淑,顾琳,赵玉倩,李臻,曹阳,张建,高艳,孙灵利.应用宏基因组纳米孔测序技术分析流行性腮腺炎样病例病原体[J].病毒学报,2023(6):1615-1622. |
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作者姓名: | 韩桃利 焦洋 赵剑虹 张淑 顾琳 赵玉倩 李臻 曹阳 张建 高艳 孙灵利 |
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作者单位: | 北京市朝阳区疾病预防控制中心 |
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摘 要: | 为了解流行性腮腺炎样病例可能的病原体,本研究采用宏基因组纳米孔技术检测22例流行性腮腺炎样病例(病例组)和17例健康人群(对照组)的腮腺管口拭子中可能的病原。针对在病例组和对照组样本测序中发现的可疑病原体,应用实时荧光PCR进行检测确认。同时应用SPSS 23.0软件对两组的检测结果进行统计分析。宏基因组测序结果发现病例组和对照组未发现有统计学差异的致病细菌。人副流感病毒3型(Human parainfluenza virus3, HPIV-3)只在病例组5例病例中检出,而人疱疹病毒7型(Human herpesvirus 7, HHV-7)分别在病例组和对照组中的4例和6例病例中检出。实时荧光PCR验证结果与宏基因组测序结果一致。进一步分析发现,病例组和对照组的HPIV-3检出率的差异具有统计学意义(χ2=9.186,P=0.011),而HHV-7检出率无统计学意义(χ2=0.364,P=0.393)。本研究结果提示HPIV-3可能是调查地区导致流行性腮腺炎样病例的病原体,在今后对流行性腮腺炎诊断并报告时应注意鉴别,并加强病原学监测和检测。
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关 键 词: | 流行性腮腺炎 宏基因组 Nanopore测序 人副流感病毒3型 人疱疹病毒7型 |
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