| 水稻SBP基因家族的生物信息学分析(英文) |
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| 引用本文： | 王翊,胡宗利,杨妤欣,陈绪清,陈国平.水稻SBP基因家族的生物信息学分析(英文)[J].生物信息学,2011,9(1):82-87,92. |
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| 作者姓名： | 王翊 胡宗利 杨妤欣 陈绪清 陈国平 |
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| 作者单位： | 1. 重庆大学,生物工程学院,重庆,400044
2. 北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心,北京,100089 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(30771463,31000911); 重庆市攻关项目(CSTC,2009AB5174)) |
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| 摘 要： | SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN-LIKE(SBP)转录因子家族是植物特有的一类转录因子。本文确定了20水稻基因组上编码的SBP基因。通过分类,染色体定位,保守区确定,亲缘关系,以及水稻SBP家族中的重复基因及该家族成员形成蛋白二聚体的可能性进行分析,其次利用了Affymetrix水稻基因组芯片数据,对所有这些基因的表达谱进行了分析。结果表明,水稻SBP基因在花和种子的发育过程中可能发挥重要作用,而其对环境胁迫却不敏感。这对进一步研究SBP的功能提供了有价值的线索和思路。
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| 关 键 词： | SBP-box 水稻 基因芯片 表达谱 |
Bioinformatics analysis of SBP-box gene family in rice |
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| WANG Yi,HU Zong-li,YANG Yu-xin,CHEN Xu-qing,CHEN Guo-ping.Bioinformatics analysis of SBP-box gene family in rice[J].China Journal of Bioinformation,2011,9(1):82-87,92. |
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| Authors: | WANG Yi HU Zong-li YANG Yu-xin CHEN Xu-qing CHEN Guo-ping |
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| Institution: | WANG Yi,HU Zong-li1,YANG Yu-xin1,CHEN Xu-qing2,CHEN Guo-ping1 (1.College of Bioengineering,Chongqing University,Chongqing 400030,China,2.Beijing Research Center of Agro-Biotechnology,Beijing 100089,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | SBP-box rice microarray expression profiling |
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