甘蓝型油菜WRKY基因家族碱基组成及密码子使用特性分析 |
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作者姓名: | 李冠英 王政 张志燕 方和娣 谭小力 |
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作者单位: | 江苏大学生命科学研究院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(编号:31071672,31271760) |
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摘 要: | WRKY转录因子广泛地参与植物的抗逆防卫反应。通过对甘蓝型油菜WRKY基因家族碱基组成和密码子用法的分析,发现其碱基组成不仅对密码子的偏好性选择有重要影响,而且与基因的表达水平参数(Nc、CAI、CBI等)显著相关。通过对密码子RSCU值的分析,得到了TTA、CTT、AGA等29个偏好密码子,且多以碱基A或T结尾。ENc-plot分析表明,除了碱基组成之外,自然选择等其它因素对密码子偏好性也有影响。
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关 键 词: | 甘蓝型油菜 BnWRKY基因 碱基组成 密码子 |
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