| 基于核糖体蛋白质标志物及MALDI-TOF MS技术快速鉴定伦茨菌属放线菌 |
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| 引用本文： | 孙伟,许杰,周万平,罗倩,张薇. 基于核糖体蛋白质标志物及MALDI-TOF MS技术快速鉴定伦茨菌属放线菌[J]. 微生物学报, 2023, 63(1): 430-445 |
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| 作者姓名： | 孙伟 许杰 周万平 罗倩 张薇 |
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| 作者单位： | 上海交通大学生命科学技术学院 仪器共享与技术服务平台, 上海 200240 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(81973230)；上海交通大学决策咨询课题(JCZXSJB-13) |
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| 摘 要： | 【目的】伦茨菌属(Lentzea)放线菌(Actinobacteria)代谢产物具有广泛的生物活性,在医药领域展现出潜在的应用价值。本研究尝试建立以核糖体蛋白质为标志物,利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight masss pectrometry,MALDI-TOF MS)技术鉴定伦茨菌属放线菌的方法。【方法】检索基因组数据库,提取伦茨菌属菌种模式菌株15种核糖体蛋白质的序列并计算理论分子量;通过分子量比对分析伦茨菌属菌种模式菌株之间及其与邻近属菌种模式菌株之间15种核糖体蛋白质的匹配度,提出鉴定至菌种及属的核糖体蛋白质匹配数标准;选取目标属和非目标属菌种进行MALDI-TOFMS测试和分析并修正鉴定标准。【结果】将待测菌株的MALDI-TOF质谱峰与伦茨菌属各菌种模式菌株的15种核糖体蛋白质分别匹配,通过最大匹配数及质谱峰强度模式可鉴定至属或种。【结论】本研究建立了基于15种核糖体蛋白质标志物及MALDI-TOF MS技术鉴定伦茨菌属放线菌的方法,可为放线菌纲其他类群的快...
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| 关 键 词： | 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 核糖体蛋白质 伦茨菌属 放线菌 鉴定 |
| 收稿时间： | 2022-05-12 |
| 修稿时间： | 2022-07-30 |
Rapid identification of Lentzea members: based on ribosomal protein biomarkers and MALDI-TOF MS |
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| SUN Wei,XU Jie,ZHOU Wanping,LUO Qian,ZHANG Wei. Rapid identification of Lentzea members: based on ribosomal protein biomarkers and MALDI-TOF MS[J]. Acta microbiologica Sinica, 2023, 63(1): 430-445 |
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| Authors: | SUN Wei XU Jie ZHOU Wanping LUO Qian ZHANG Wei |
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| Affiliation: | Core Facility and Technical Service Center, School of Life Sciences and Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) ribosomal protein Lentzea Actinobacteria identification |
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