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ChIP技术及其在基因组水平上分析DNA与蛋白质相互作用
引用本文:李敏俐,王薇,陆祖宏. ChIP技术及其在基因组水平上分析DNA与蛋白质相互作用[J]. 遗传, 2010, 32(3): 219-228. DOI: 10.3724/SP.J.1005.2010.00219
作者姓名:李敏俐  王薇  陆祖宏
作者单位:1. 东南大学生物电子学国家重点实验室, 南京 210096; 2. 东南大学儿童发展与学习科学教育部重点实验室, 南京 210096
基金项目:国家自然科学基金项目(编号:30871393)资助
摘    要:染色质免疫沉淀(Chromatin immunoprecipitaion, ChIP)技术是分析细胞内生理状态下DNA结合蛋白与基因组DNA相互作用的技术。ChIP与高密度芯片(ChIP-chip)或高通量测序(ChIP-Seq)相结合能产生大量的研究数据, 在细胞的基因表达调控网络研究中发挥重要作用。文章主要介绍ChIP、ChIP-chip和ChIP-Seq的技术特点以及发展趋势, 重点讨论了ChIP-Seq数据分析方法及相关的应用实例。

关 键 词:基因组  ChIP-Seq  ChIP-chip  
收稿时间:2009-06-23
修稿时间:2009-08-27

Genomic analysis of DNA-protein interaction by chromatin immunoprecipitation
LI Min-Li,WANG Wei,LU Zu-Hong. Genomic analysis of DNA-protein interaction by chromatin immunoprecipitation[J]. Hereditas, 2010, 32(3): 219-228. DOI: 10.3724/SP.J.1005.2010.00219
Authors:LI Min-Li  WANG Wei  LU Zu-Hong
Affiliation:1. The State Key Laboratory of Bioelectronics, Southeast University, Nanjing 210096, China; 2. Key Laboratory of Child Development and Learning Science, Ministry of Education, Southeast University, Nanjing 210096, China
Abstract:
Keywords:ChIP-chip  genome  ChIP-Seq  ChIP-chip
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