| 稳定性同位素核酸探针技术DNA-SIP 原理与应用 |
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| 引用本文： | 贾仲君. 稳定性同位素核酸探针技术DNA-SIP 原理与应用[J]. 微生物学报, 2011, 51(12): 1585-1594 |
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| 作者姓名： | 贾仲君 |
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| 作者单位： | 中国科学院南京土壤研究所,土壤与农业可持续发展国家重点实验室,南京210008 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金委重大项目(41090281);中国科学院知识创新工程重要方向项目(KZCX2-YW-BR-06，KSCX2-EW-G-16);科技部国际科技合作与交流项目(2010DFA22770) |
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| 摘 要： | 稳定性同位素核酸探针技术DNA-SIP(Stable isotope probing),是将复杂环境中微生物物种组成及其生理功能耦合分析的有力工具.微生物的体积在μm尺度,因此,自然环境中微生物群落在μm尺度下生理过程的发生、发展,其新陈代谢物质在环境中累积与消减的动力学变化规律,形成了微生物生理生态过程,决定了不同尺度下生态系统物质和能量的良性循环.利用稳定性同位素示踪复杂环境中微生物基因组DNA,实现了单一微生物生理过程研究向微生物群落生理生态研究的转变,能在更高更复杂的整体水平上定向发掘重要微生物资源,推动微生物生理生态学和生物技术开发应用.本文重点探讨了DNA-SIP的技术原理、主要技术瓶颈及对策,初步展望了DNA-SIP为基础的环境微生物基因组学发展趋势.
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| 关 键 词： | 微生物生理生态学 稳定性同位素核酸探针技术 DNA-SIP 环境基因组学 |
| 收稿时间： | 2011-05-05 |
| 修稿时间： | 2011-07-04 |
Principle and application of DNA-based stable isotope probing---a review |
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| Zhongjun Jia. Principle and application of DNA-based stable isotope probing---a review[J]. Acta microbiologica Sinica, 2011, 51(12): 1585-1594 |
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| Authors: | Zhongjun Jia |
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| Affiliation: | Zhongjun Jia State Key Laboratory of Soil and Sustainable Agriculture,Institute of Soil Science,Chinese Academy of Sciences,Nanjing 210008,China |
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| Abstract: | Microbial communities are the engines that drive the global biogeochemical cycle of carbon and nitrogen essential for life on Earth.However,microorganisms have evolved as a result of complex interactions with other organisms and environments.Deciphering the metabolism of microorganisms at the community level in nature will be crucial for a better understanding of the mechanisms that lead to the enormous divergence of microbial ecophysiology.Due to the immense number of uncultivated microbial species and the... |
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| Keywords: | microbial ecophysiology DNA-SIP metagenomics next-generation sequencing technology |
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