| 丹参肉桂酰辅酶A还原酶基因克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 陈尘,王政军,曹鑫林,王喆之.丹参肉桂酰辅酶A还原酶基因克隆与生物信息学分析[J].西北植物学报,2011,31(10). |
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| 作者姓名： | 陈尘 王政军 曹鑫林 王喆之 |
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| 作者单位： | 1. 教育部药用资源与天然药物化学重点实验室,西北濒危药材资源开发国家工程实验室,陕西师范大学生命科学学院,西安710062
2. 西安铁一中,西安,710054 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31000134); 陕西师范大学研究生培养创新基金(2011CXS034) |
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| 摘 要： | 分析丹参转录组数据库,获得一条新的肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoA reductase,CCR)基因,命名为SmCCR-2(GenBank注册号为JF784010)。该基因包含一个长为966 bp的完整开放读码框,编码321个氨基酸残基。生物信息学分析显示,SmCCR-2编码的蛋白具有NWYCY基序,属于NABD_Rossmann超家族,相对分子量为35.80 kD;预测SmCCR-2为中性亲水的稳定蛋白,存在跨膜结构域。实时荧光定量PCR结果表明,SmCCR-2基因在丹参各组织都有表达,茎中表达量最高。其表达受到病原菌的影响,表明SmCCR-2基因可能与植物防御反应有关。
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| 关 键 词： | 丹参 SmCCR-2 生物信息学分析 表达模式 |
Bioinformatics and Expression Analysis of Cinnamoyl-CoA Reductase Gene from Salvia miltiorrhiza Bunge |
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| CHEN Chen,WANG zheng-jun,CAO Xin-lin,WANG Zhe-zhi.Bioinformatics and Expression Analysis of Cinnamoyl-CoA Reductase Gene from Salvia miltiorrhiza Bunge[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2011,31(10). |
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| Authors: | CHEN Chen WANG zheng-jun CAO Xin-lin WANG Zhe-zhi |
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| Institution: | CHEN Chen1,WANG zheng-jun1,CAO Xin-lin2,WANG Zhe-zhi1*(1 Key Laboratory of Ministry of Education for Medicinal Resources and Natural Pharmaceutical Chemistry,National Engineering Laboratory for Resource Developing of Endangered Chinese Crude Drugs in Northwest of China,College of Life Sciences,Shaanxi Normal University,Xi'an 710062,China,2 Xi'an Tie Yi High School,Xi'an 710054,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Salvia miltiorrhiza Bunge SmCCR-2 bioinformatics analysis expression analysis |
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