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利用一种新的网上工具Scansite进行蛋白质磷酸化预测
引用本文:唐颖,张令强,贺福初.利用一种新的网上工具Scansite进行蛋白质磷酸化预测[J].生物工程学报,2004,20(4):623-626.
作者姓名:唐颖  张令强  贺福初
作者单位:军事医学科学院放射医学研究所,北京,100850
基金项目:国家高技术研究发展计划 ( 863计划 )课题 (No .2 0 0 1AA2 2 1111)~~
摘    要:Scansite分析软件是近两年建立的一种新的利用因特网,基于蛋白质分子中较短的模序进行蛋白质磷酸化和蛋白质蛋白质相互作用预测的工具。这里综述了Scansite的使用方法、功能介绍及与其他磷酸化分析软件的比较,并展望了Scansite在进行磷酸化预测中面临的问题和应用前景。

关 键 词:Scansite    磷酸化    模序
文章编号:1000-3061(2004)04-0623-04
修稿时间:2003年11月18

A Motif-based Scanning Approach for Prediction of Protein Phosphorylation
TANG Ying,ZHANG Ling,Qiang,HE Fu,Chu.A Motif-based Scanning Approach for Prediction of Protein Phosphorylation[J].Chinese Journal of Biotechnology,2004,20(4):623-626.
Authors:TANG Ying  ZHANG Ling  Qiang  HE Fu  Chu
Institution:Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing 100850, China.
Abstract:Scansite is a short linear motif based scanning approach established in the latest two years. It's accessible over the World Wide Web and can be used to identify sequence motifs likely to be phosphorylated by specific protein kinases or likely to bind to specific protein domains such as 14 3 3, SH2 and SH3 domains. The usage and function of the potent approach were reviewed and compared with previously established tools for phosphorylation prediction. The facing problems and application outlook of Scansite in prediction of cell signaling networks within proteomes were also presented.
Keywords:Scansite  protein phosphorylation  motif
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