| 利用 MSAP 分析18个芥蓝齐口期的表观遗传多样性 |
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| 引用本文： | 史卫东*,黄如葵,陈振东,罗海玲,康红卫,梁家作,刘杏连.利用 MSAP 分析18个芥蓝齐口期的表观遗传多样性[J].基因组学与应用生物学,2012,0(5):505-512. |
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| 作者姓名： | 史卫东* 黄如葵 陈振东 罗海玲 康红卫 梁家作 刘杏连 |
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| 作者单位： | 广西农科院蔬菜研究所, 南宁, 530007 |
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| 基金项目： | 广西农业科学院基本科研业务专项(2012JZ06和桂农科2012YT05);广西作物遗传改良生物技术重点实验室开放课题子课题(桂科能0815011-6-1)共同资助 |
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| 摘 要： | 本研究利用MSAP检测18个芥蓝齐口期DNA甲基化水平,分析了表观遗传多样性,探讨DNA甲基化模式对齐口期的影响。结果表明,18个芥蓝齐口期平均为50d,叶片数平均为10片,齐口期和叶片数不相关(相关系数为0.296);变异系数分别为21%和18%;遗传距离分布在0~40,平均值为12.2276,在10.62处分为3类。MSAP分析表明,5对引物组合扩增得到432条多态性条带,201条片段表现出多态性,多态性比率为47%;Nei遗传距离分布在0.004~0.467,平均值为0.0958,表明遗传多样性水平较低;在0.04处分为3类。Mantel测验表明两种分析的遗传距离相关系数为-0.1366,显示齐口期、叶片数与DNA甲基化多态性没有相关性。DNA甲基化模式分析表明,非甲基化片段为110条,甲基化多态性片段为322条,分为3种带型,类型一为非甲基化带型(110条),类型二为甲基化带型(110条),类型三为半甲基化带型(152条),非甲基化片段和半甲基化片段在不同品种之间呈现多态性,甲基化片段在不同品种之间呈现多态性与单态性相差不大,显示MSAP多态性主要来源于非甲基化和半甲基化片段,芥蓝甲基化模式以半甲基化为主。本文推测DNA甲基化水平降低参与芥蓝齐口期调控,MSAP分析既可用于基因组结构研究,又可用于基因组水平上性状的功能研究。
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| 关 键 词： | 芥蓝 表观遗传多样性 MSAP分析 |
The Epigenetic Genetic Diversity of 18 Chinese Kales Analyzed by MSAP when Initiated Flowering |
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| Shi Weidong,Huang Ruikui Chen Zhendong Luo Hailing Kang Hongwei Liang Jiazuo Liu Xinglian.The Epigenetic Genetic Diversity of 18 Chinese Kales Analyzed by MSAP when Initiated Flowering[J].Genomics and Applied Biology,2012,0(5):505-512. |
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| Authors: | Shi Weidong Huang Ruikui Chen Zhendong Luo Hailing Kang Hongwei Liang Jiazuo Liu Xinglian |
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| Institution: | Shi Weidong Huang Ruikui Chen Zhendong Luo Hailing Kang Hongwei Liang Jiazuo Liu Xinglian The Institute of Vegetable of Guangxi Academy of Agricultural Sciences, Nanning, 530007 |
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