| 致病性与无致病性茄科罗尔斯通氏菌转录组测序与分析 |
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| 引用本文： | 周大祥,龙泉洲,李彦杰,邓雪松. 致病性与无致病性茄科罗尔斯通氏菌转录组测序与分析[J]. 微生物学杂志, 2021, 0(5): 80-88 |
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| 作者姓名： | 周大祥 龙泉洲 李彦杰 邓雪松 |
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| 作者单位： | 重庆三峡学院 生物与食品工程学院，重庆 万州 404120;重庆三峡医药高等专科学校 基础医学部，重庆 万州 404120 |
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| 基金项目： | 重庆市自然科学基金项目(cstc2016jcyjA0198) |
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| 摘 要： | 为了挖掘茄科罗尔斯通氏菌（Ralstonia solanacearum）致病相关基因，分别提取致病性（RS+）和无致病性（RS-）茄科罗尔斯通氏菌的总RNA进行转录组测序。两组测序数据经组装后得到5 111条Contigs，RS-和RS+对比发现779条差异表达基因（DEGs），其中上调表达376条，下调表达403条。功能注释显示，这些DEGs主要集中在氨基酸代谢、膜转运、细胞运动和翻译等途径。信号通路富集显示，茄科罗尔斯通氏菌对寄主的响应由众多信号通路共同参与，其作用方式可能包括增强细菌趋化性、强化鞭毛组装能力、提高细菌分泌系统、上调双组分信号转导系统、调整MAPK信号通路和增强氨基酸代谢等。转录组测序还发现许多毒力基因，其中茄科罗尔斯通氏菌Ⅲ型分泌系统的hrp基因簇中的23个基因，有16个在无致病性茄科罗尔斯通氏菌中下调表达。随机挑选4个DEGs进行qPCR分析，荧光定量结果与测序数据基本一致，说明基于转录组分析DEGs的表达较为可靠。研究为进一步深入探究茄科罗尔斯通氏菌致病分子机理提供参考。
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| 关 键 词： | 茄科罗尔斯通氏菌；致病性；转录组；差异表达基因（DEGs）；致病相关基因 |
Transcriptome Sequencing and Analysis of Pathogenicity and Apathogenicity of Ralstonia solanacearum |
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| ZHOU Da-xiang,LONG Quan-zhou,LI Yan-jie,DENG Xue-song. Transcriptome Sequencing and Analysis of Pathogenicity and Apathogenicity of Ralstonia solanacearum[J]. Journal of Microbiology, 2021, 0(5): 80-88 |
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| Authors: | ZHOU Da-xiang LONG Quan-zhou LI Yan-jie DENG Xue-song |
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| Affiliation: | Coll. of Biol. & Food Engin., Chongqing Three Gorges Coll., Wanzhou 404120; Dept. of Basic Med., Chongqing Three Gorges Med. Coll., Wanzhou 404120 |
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