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| 黑麂MHC - DQA2 基因多态性 | |
| 引用本文： | 朱飞虎,闫计春,骆涛林,虞健,吴海龙. 黑麂MHC - DQA2 基因多态性[J]. 兽类学报, 2011, 31(1): 90-96 |
| 作者姓名： | 朱飞虎 闫计春 骆涛林 虞健 吴海龙 |
| 作者单位： | 安徽师范大学生命科学学院, 安徽省高校生物环境与生态安全省级重点实验室,安徽省重要生物资源保护与利用省级重点实验室,芜湖 241000 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，安徽省优秀青年基金资助项目，安徽省自然科学基金资助项目 |
| 摘 要： | 利用牛特异性扩增DQA2 第2 外显子的嵌套引物,对黑麂基因组DNA 进行PCR 扩增和克隆测序,基于该 序列设计出黑麂DQA2 基因第2 外显子特异性引物。利用该引物,通过PCR - SSCP 以及克隆测序技术,从40 个 黑麂样品中获得4 个不同的DQA2 等位基因。没有一个个体同时具有2 个以上的等位基因,所有序列均不含插入 或缺失突变,不含终止密码子,因此,本研究所扩增的DQA2 基因可能是表达的单基因座位。抗原结合区(Peptide binding region,PBR)非同义替换率(dn)显著大于同义替换率(ds) (P <0.05),暗示该座位曾经历过明 显的正选择作用;进一步利用CODEML 程序中的相关模型以及贝叶斯法检测出4 个受选择作用的氨基酸位点 (α11、α58、α62、α66),这4 个位点均位于PBR 区。基于NJ 法构建的部分偶蹄类DQA 外显子2 系统发生关系 显示,黑麂4 个DQA2 等位基因与牛、羊以及梅花鹿的DQA2 等位基因构成独立的进化枝,在该进化枝内,黑麂 DQA2 等位基因优先与牛DQA2 等位基因聚类,暗示黑麂DQA2 基因在进化过程中存在跨物种进化现象。上述结 果表明平衡选择是维持黑麂DQA2 基因多态性的主要机制。然而,本研究从40 个样品中仅检测出2 个杂合子, 黑麂DQA2 等位基因之间的频率存在显著差异,推测可能是所检测的样品来源于不同种群,由于华伦德效应 (The Whalund effect)导致杂合度降低,也不排除本文所设计的引物在PCR 扩增过程中存在无效等位基因。 |
| 关 键 词： | 黑麂 MHC DQA2 多态性 平衡选择 跨物种进化 |
Polymorphism of MHC-DQA2 in black muntjac(Muntiacus crinifrons) |
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| ZHU Feihu,YAN Jichun,LUO Taolin,YU Jian,WU Hailong. Polymorphism of MHC-DQA2 in black muntjac(Muntiacus crinifrons)[J]. Acta Theriologica Sinica, 2011, 31(1): 90-96 | |
| Authors: | ZHU Feihu YAN Jichun LUO Taolin YU Jian WU Hailong |
| Affiliation: | Key Laboratory of Biotic Environment and Ecological Safety in Anhui Province,Anhui Provincial Key Laboratory of the Conservation and Exploitation of Biological Resources,College of Life Science,Anhui Normal University,Wuhu 241000,China |
| Abstract: | A set of nested primers specific to cattle DQA loci was used to amplify genomic DNA of the black muntjac(Muntiacus crinifrons)using PCR.The obtained sequences showed high similarity to those of DQA2 exon 2 sequences from cattle,sheep,and sika deer.Based on the sequences,a new pair of primers specific to DQA2 locus of the black muntjac was designed and used to analyze samples of this species using PCR-SSCP and sequencing.In total,four distinct DQA2 exon 2 sequences were obtained from forty individuals and no... |
| Keywords: | MHC DQA2 |
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