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| 正反向测序信息在全基因组序列拼接及分析中的应用 | |
| 引用本文： | 韩玉军,倪培相,吕宏,叶葭,胡建飞,陈晨,黄显刚,丛丽娟,李光远,王晶,顾孝诚,于军,李松岗.正反向测序信息在全基因组序列拼接及分析中的应用[J].中国科学C辑,2004,34(6):575-581. |
| 作者姓名： | 韩玉军 倪培相 吕宏 叶葭 胡建飞 陈晨 黄显刚 丛丽娟 李光远 王晶 顾孝诚 于军 李松岗 |
| 作者单位： | 1. 北京大学生命科学学院,北京,100871;中国科学院北京基因组研究所暨北京华大基因研究中心,北京,101300 2. 中国科学院北京基因组研究所暨北京华大基因研究中心,北京,101300 3. 沃森基因组研究所,浙江大学,杭州,310012 4. 北京大学生命科学学院,北京,100871 |
| 摘 要： | 插入片段双末端正反向测序信息(double-barreled data, DB信息)已广泛应用于大基因组测序组装项目. 根据绘制籼稻全基因组工作框架图的经验, 总结了DB信息在序列组装流程中的应用, 同时, 在原有基础上提出了改进的DB信息使用方法, 包括基因组序列拼接、质量检验和重叠群的连接. 此外, 进一步提出了DB信息在下游数据分析过程中新的应用, 包括利用DB信息获得基因组文库中每个克隆所包含的基因组片段的精确信息, 以及在此基础上设计低成本全基因组基因芯片的一种基因芯片设计新方法. 随着待测序物种的逐年增多, 相信正反向测序信息在基因组测序组装工作, 以及后续的基因组研究中将发挥越来越重要的作用. |
| 关 键 词： | 正反向测序信息 应用 全基因组芯片 基因组 |
| 收稿时间： | 2004-03-13 |
| 修稿时间： | 2004年7月13日 |
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