| 拟南芥SDIR1基因转录的选择性剪接 |
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| 引用本文： | 武晓璐,汤晓倩,于丽霞,姚有林,鄢波. 拟南芥SDIR1基因转录的选择性剪接[J]. 云南植物研究, 2010, 32(2): 141-146. DOI: 10.3724/SP.J.1143.2010.09239 |
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| 作者姓名： | 武晓璐 汤晓倩 于丽霞 姚有林 鄢波 |
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| 作者单位： | 西南林学院园林学院,云南,昆明,650224 |
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| 基金项目： | 西南林学院人才引进启动项目，省部级重点学科、省高校重点实验室及校实验室共享平台资助项目 |
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| 摘 要： | 采用PCR及RT-PCR法分别克隆了拟南芥SDIR1基因的DNA和cDNA序列。根据序列比对分析结果,发现了3种不同的转录本,提示SDIR1基因的转录中存在选择性剪接。3种转录本的长度分别为822bp、691bp和666bp,依次命名为：SDIR1-822、SDIR1-691、SDIR1-666。与SDIR1基因的DNA序列及已报道的SDIR1cDNA序列比较,除转录本SDIR1-822包含了完整的编码序列外,其余2种转录本的编码序列都存在不同长度的缺失。其中,SDIR1-691缺失了131bp的片段：第2外显子3′端缺失33bp,第3外显子53bp全部缺失,第4外显子5′端缺失45bp;转录本SDIR1-666缺失了156bp的片段：第3外显子3′端缺失18bp,第4外显子5′端缺失138bp。进而随机挑取101个克隆子对三种转录本的表达比例进行初步分析,结果表明3种分子的比值为SDIR1-822：SDIR1-691：SDIR1-666=26.00：1.33：1.00,反映出SDIR1基因不同转录本在拟南芥中的相对表达量。
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| 关 键 词： | SDIR1基因 选择性剪接 拟南芥 |
Alternative Splicing of SDIR1 Gene in Arabidopsis thaliana (Cruciferae) |
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| WU Xiao-Lu,TANG Xiao-Qian,YU Li-Xia,YAO You-Lin,YAN Bo. Alternative Splicing of SDIR1 Gene in Arabidopsis thaliana (Cruciferae)[J]. Acta Botanica Yunnanica, 2010, 32(2): 141-146. DOI: 10.3724/SP.J.1143.2010.09239 |
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| Authors: | WU Xiao-Lu TANG Xiao-Qian YU Li-Xia YAO You-Lin YAN Bo |
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| Affiliation: | (Faculty of Landscape Architecture;Southwest Forestry College,Kunming 650224,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | SDIR1 gene Alternative splicing Arabidopsis thaliana |
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