| 烤烟SNARE蛋白基因T-NTGP2全长cDNA克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 胡重怡,蔡刘体. 烤烟SNARE蛋白基因T-NTGP2全长cDNA克隆与生物信息学分析[J]. 生物技术通报, 2011, 0(7) |
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| 作者姓名： | 胡重怡 蔡刘体 |
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| 作者单位： | 贵州烟草科学研究所,贵阳,550081 |
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| 基金项目： | 中国烟草总公司资助项目，贵州省烟草专卖局资助项目 |
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| 摘 要： | 从烤烟品种南江3号(Nicotiana tobacum cv.Nanjiang-3)均一化cDNA文库中克隆获得一个SNARE蛋白同源性较高的cDNA全长序列,命名为T-NTGP2,GenBank中的登录号为HO663897.利用ORF finder和ProtParam软件分析显示,它包含一个长度为597 bp的完整开放读码框,编码一个含有199个氨基酸、等电点为6.96、分子量为22.59 kD的蛋白.Blast搜索结果及进化分析结果表明,烤烟T-NTGP2基因编码的蛋白与烤烟、杨树和蓖麻的Ykt6蛋白具有较高的同源性,其一致性分别为99％、91％和91％.该基因编码的蛋白具有一个典型的VAMP基元,同源分析表明该蛋白属于SNAREs中特殊longins中的Ykt6蛋白.
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| 关 键 词： | 烤烟 SNARE 克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of a SNARE Protein T-NTGP2 cDNA from Flue-cured Tobacco |
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| Hu Zhongyi,Cai Liuti. Cloning and Bioinformatics Analysis of a SNARE Protein T-NTGP2 cDNA from Flue-cured Tobacco[J]. Biotechnology Bulletin, 2011, 0(7) |
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| Authors: | Hu Zhongyi Cai Liuti |
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