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甜菜NADH-NR基因的克隆和序列分析
引用本文:丁广洲,侯静,陈丽,马凤鸣,陈连江.甜菜NADH-NR基因的克隆和序列分析[J].生物技术通报,2011(10).
作者姓名:丁广洲  侯静  陈丽  马凤鸣  陈连江
作者单位:1. 中国农业科学院甜菜研究所,哈尔滨150080;东北农业大学农学院,哈尔滨150030
2. 东北农业大学农学院,哈尔滨,150030
3. 中国农业科学院甜菜研究所,哈尔滨,150080
基金项目:黑龙江大学博士科研基金项目(B80211); 国家自然科学基金项目(30571096)
摘    要:利用同源序列克隆方法从标准偏高糖型甜菜品种甜研7号(Ty7)中获得氯素诱导NADH-NR基因片段,通过RACE技术克隆NADH-NR基因全长序列.该基因ORF长度2 718 bp,编码905个氨基酸,包括147 bp的5'UTR和382 bp的3' UTR,GenBank上的注册号为EU163265,基因编码蛋白的等电点为6.12,推测分子量大小为102 kD,C端(778-891 aa)有一个跨膜区域.基因编码多肽含有3个氧化还原功能区:钼辅因子功能区(eukary NR Moco,93 - 478aa),Fe-血红素结合区(Cytb5,535 -608 aa),FAD结合区(FAD binding 6,653 -760 aa).在甜研7号NR下游的氨基酸残基中含有NADH-NR特有的CGPPP-M基序,说明该蛋白以NADH为电子供体.通过比对,甜研7号的NADH-NR基因与菠菜NADH-NR基因同源性最高,为86.18%.经Southem杂变检验,甜研7号中NADH-NR基因以低拷贝数存在.经基因组克隆分析,甜研7号NADH-NR含有3个内含子,4个外显子.

关 键 词:甜研7号  NADH-NR基因  克隆  序列分析

Cloning and Sequence Analysis of the NADH-NR Gene in Sugar Beet (Beta vulgaris L.)
Ding Guangzhou,Hou Jing,Chen Li,Ma Fengming,Chen Lianjiang.Cloning and Sequence Analysis of the NADH-NR Gene in Sugar Beet (Beta vulgaris L.)[J].Biotechnology Bulletin,2011(10).
Authors:Ding Guangzhou  Hou Jing  Chen Li  Ma Fengming  Chen Lianjiang
Institution:Ding Guangzhou1,2 Hou Jing2 Chen Li1 Ma Fengming2 Chen Lianjiang1(1Sugar Beet Institute of Chinese Academy of Agricultural Science,Harbin 150080,2Agronomy College of Northeast Agriculture University,Harbin 150030)
Abstract:
Keywords:Ty7 NADH-NR gene Cloning Sequence analysis  
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