| 利用染色质免疫共沉淀技术确定转录因子RIN调控的靶基因 |
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| 引用本文： | 李玲,傅达奇,朱毅,田慧琴,罗云波,朱本忠.利用染色质免疫共沉淀技术确定转录因子RIN调控的靶基因[J].生物技术通报,2011(12). |
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| 作者姓名： | 李玲 傅达奇 朱毅 田慧琴 罗云波 朱本忠 |
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| 作者单位： | 1. 天津农学院食品科学系,天津,300384
2. 中国农业大学食品科学与营养工程学院 食品生物技术实验室,北京,100083 |
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| 摘 要： | 以粉红期番茄果实为材料,用含不同浓度甲醛的缓冲液交联DNA和蛋白质,利用超声波将其染色质随机断裂成大小为200-1 000 bp的片段,用RIN蛋白的特异性抗体免疫沉淀与RIN蛋白结合的DNA片段,然后解交联和纯化DNA片段,最终用普通PCR试验和测序验证与转录因子RIN结合的DNA序列.结果表明,适用于番茄果实的最佳ChIP试验条件为:用1％甲醛溶液交联DNA和蛋白质的复合物；用20％功率,工作6s,间隔10s,脉冲3次超声破碎该复合物,可以得到适当大小的片段,用于后续的试验.普通PCR和测序验证结果证明转录因子RIN与LeACS2和LeACS4启动子区域的CArG box序列结合.
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| 关 键 词： | 染色质免疫共沉淀技术 转录因子RIN LeACS2基因 LeACS4基因 番茄果实 |
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